47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0914 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  52.44 
 
 
165 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  47.65 
 
 
169 aa  170  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  48.8 
 
 
171 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.15 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  38.82 
 
 
199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.18 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
186 aa  124  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  35.8 
 
 
189 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  38.41 
 
 
169 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.43 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  39.63 
 
 
162 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  41.25 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  41.82 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.47 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.94 
 
 
168 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.94 
 
 
177 aa  105  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  35.93 
 
 
170 aa  104  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  34.52 
 
 
165 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  32.93 
 
 
165 aa  101  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  33.94 
 
 
185 aa  101  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  35.37 
 
 
163 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  40.36 
 
 
166 aa  99.8  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  34.86 
 
 
169 aa  98.6  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  32.53 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  29.94 
 
 
180 aa  98.2  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 
177 aa  97.8  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  33.94 
 
 
162 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  37.06 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 
192 aa  92.8  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  37.72 
 
 
161 aa  92  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  31.1 
 
 
162 aa  92.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.17 
 
 
178 aa  92  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.93 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  31.93 
 
 
169 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.93 
 
 
158 aa  87  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.12 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  28.74 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  35.76 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  29.07 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  27.91 
 
 
166 aa  72  0.000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  35.37 
 
 
162 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  32.56 
 
 
127 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  24.24 
 
 
172 aa  64.3  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.33 
 
 
159 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  26.38 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.45 
 
 
550 aa  40.8  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>