46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0976 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
177 aa  361  3e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  67.7 
 
 
178 aa  231  5e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  49.69 
 
 
165 aa  180  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  47.85 
 
 
169 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  47.83 
 
 
165 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  45.68 
 
 
169 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  45.12 
 
 
165 aa  158  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.34 
 
 
168 aa  156  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  45.96 
 
 
169 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  46.3 
 
 
168 aa  152  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  45.96 
 
 
162 aa  148  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.52 
 
 
170 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  42.86 
 
 
185 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.51 
 
 
163 aa  141  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  38.27 
 
 
168 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  39.88 
 
 
171 aa  124  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.57 
 
 
170 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.54 
 
 
158 aa  122  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  36.14 
 
 
199 aa  117  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  35.22 
 
 
161 aa  108  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  31.71 
 
 
169 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  34.29 
 
 
180 aa  105  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.32 
 
 
199 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  33.13 
 
 
186 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.13 
 
 
173 aa  97.8  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 
165 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 
167 aa  94.4  9e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.49 
 
 
165 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  34.34 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.93 
 
 
172 aa  85.5  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.88 
 
 
177 aa  85.1  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  29.01 
 
 
162 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  33.53 
 
 
192 aa  79  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  28.31 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.33 
 
 
170 aa  75.9  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  29.88 
 
 
162 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  30.34 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  28.99 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.68 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  25.44 
 
 
165 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  58.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  27.82 
 
 
127 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  29.7 
 
 
162 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  26.79 
 
 
172 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>