54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1022 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  100 
 
 		 159 aa  323  8.000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  43.56 
 
 		 170 aa  143  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  43.83 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.81 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  38.04 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  39.75 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.37 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  39.26 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  38.04 
 
 		 168 aa  123  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  37.65 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  39.26 
 
 		 169 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 		 168 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  35.19 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  38.27 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  39.88 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.02 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.16 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  34.55 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  31.06 
 
 		 177 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  31.48 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  38.04 
 
 		 161 aa  95.9  2e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  35.4 
 
 		 199 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  30.06 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  31.25 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 		 161 aa  87.8  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  32.92 
 
 		 166 aa  86.3  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  31.48 
 
 		 165 aa  85.9  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  31.9 
 
 		 186 aa  85.1  4e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.32 
 
 		 177 aa  83.6  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.43 
 
 		 199 aa  84  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  29.45 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.33 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.38 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  27.37 
 
 		 180 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  30.86 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  29.7 
 
 		 162 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.83 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  28.75 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  34.55 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  30.53 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.94 
 
 		 170 aa  67  0.00000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  28.4 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  31.48 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  21.25 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  23.6 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1717  CRISPR-associated protein Cas4  25.95 
 
 		 200 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0505  CRISPR-associated protein Cas4  25.41 
 
 		 196 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0522  CRISPR-associated protein Cas4  25.41 
 
 		 196 aa  48.5  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00230563  hitchhiker  0.00000101589 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1150  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.25 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.686649  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2291  CRISPR-associated protein Cas4  30.26 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.7 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  24.53 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0755  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.86 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.714771  normal  0.862744 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  27.49 
 
 		 193 aa  41.2  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>