46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2429 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
165 aa  330  4e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  56.52 
 
 
162 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  52.17 
 
 
165 aa  183  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  46.58 
 
 
168 aa  167  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  52.17 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.34 
 
 
165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  45.12 
 
 
177 aa  158  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  46.01 
 
 
169 aa  157  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  42.24 
 
 
168 aa  151  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  45.34 
 
 
178 aa  147  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  43.21 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  40.37 
 
 
170 aa  143  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  39.39 
 
 
185 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.89 
 
 
163 aa  140  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.78 
 
 
158 aa  134  8e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  42.59 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  38.12 
 
 
199 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  38.04 
 
 
186 aa  120  8e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.53 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  36.65 
 
 
161 aa  115  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  37.42 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  38.04 
 
 
165 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  34.38 
 
 
171 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  37.89 
 
 
189 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 
169 aa  103  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  39.75 
 
 
159 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.93 
 
 
173 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.86 
 
 
199 aa  99  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  41.36 
 
 
192 aa  98.6  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  28.92 
 
 
166 aa  97.8  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  31.71 
 
 
177 aa  94.7  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  31.33 
 
 
163 aa  89  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  31.48 
 
 
167 aa  87  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  26.22 
 
 
165 aa  87  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  32.1 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  32.2 
 
 
180 aa  84.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  31.71 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  32.52 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  30.3 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  32.73 
 
 
162 aa  75.5  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.75 
 
 
172 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  34.13 
 
 
170 aa  72  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  28.4 
 
 
172 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  26.15 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1391  hypothetical protein  28.83 
 
 
171 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.268781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>