13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2270 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2270  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 201 aa  412  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1816  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.115857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1722  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.97 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.523221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2603  hypothetical protein  30.51 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.519513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  22.03 
 
 		 169 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0576  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.67 
 
 		 180 aa  49.3  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.252977  normal  0.0673929 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0546  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  24.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2723  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.45 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0536  protein of unknown function DUF83  27.61 
 
 		 170 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0740  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.4 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.593112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.21 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  23.71 
 
 		 219 aa  41.6  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.17 
 
 		 172 aa  41.2  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>