More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0065 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 
489 aa  1003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.56 
 
 
483 aa  311  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  39.84 
 
 
488 aa  301  2e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  39.6 
 
 
482 aa  293  5e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.17 
 
 
485 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  38.43 
 
 
482 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 
485 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 
484 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.12 
 
 
480 aa  285  1e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.17 
 
 
487 aa  285  1e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  39.3 
 
 
490 aa  277  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  36.64 
 
 
480 aa  276  7e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  37.82 
 
 
489 aa  274  2e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  36.35 
 
 
481 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.89 
 
 
493 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  36.02 
 
 
490 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.63 
 
 
483 aa  262  1e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  38.1 
 
 
485 aa  261  3e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  34.2 
 
 
486 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  38.21 
 
 
488 aa  259  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
491 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
491 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  33.99 
 
 
491 aa  256  6e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.9 
 
 
489 aa  256  9e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.33 
 
 
491 aa  256  9e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.11 
 
 
485 aa  254  2e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  35.12 
 
 
495 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  33.27 
 
 
491 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
488 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  35.94 
 
 
489 aa  246  5e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  34.18 
 
 
481 aa  242  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
486 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.81199e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.93 
 
 
493 aa  231  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  33.27 
 
 
504 aa  228  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  33.73 
 
 
501 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  32.48 
 
 
491 aa  219  8e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  32.94 
 
 
503 aa  213  8e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 
490 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  33.4 
 
 
504 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  31.78 
 
 
492 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.94 
 
 
472 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.35 
 
 
478 aa  192  9e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  31.03 
 
 
972 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.86 
 
 
458 aa  190  6e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 
470 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.01617e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  31.92 
 
 
493 aa  186  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.54 
 
 
503 aa  184  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  29.19 
 
 
476 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  31.51 
 
 
473 aa  180  5e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  31.27 
 
 
461 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  30.42 
 
 
471 aa  176  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  30.99 
 
 
933 aa  174  3e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.58 
 
 
924 aa  164  4e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  30.75 
 
 
578 aa  159  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  29.4 
 
 
547 aa  156  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  30.22 
 
 
577 aa  155  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  29.08 
 
 
921 aa  151  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.67 
 
 
573 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  28.79 
 
 
487 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  29.68 
 
 
584 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  29.13 
 
 
487 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1011  peptidoglycan glycosyltransferase  29.21 
 
 
551 aa  145  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.362727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  30.21 
 
 
579 aa  144  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0091  peptidoglycan glycosyltransferase  31.36 
 
 
709 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371789  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
954 aa  143  6e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  29 
 
 
570 aa  142  1e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  28.57 
 
 
695 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3385  penicillin-binding protein 2  28.54 
 
 
716 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.157729  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0345  penicillin-binding protein 2  29.33 
 
 
557 aa  136  9e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1272  stage V sporulation protein D  29.69 
 
 
645 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.144454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  31.5 
 
 
645 aa  132  1e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2494  peptidoglycan glycosyltransferase  31.17 
 
 
645 aa  132  2e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2015  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
649 aa  130  5e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  28.79 
 
 
611 aa  130  7e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0495  penicillin-binding protein 2  29.09 
 
 
775 aa  130  7e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  31 
 
 
643 aa  129  9e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14210  Peptidoglycan glycosyltransferase  28.67 
 
 
671 aa  129  1e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.18475e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  28.99 
 
 
610 aa  129  1e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  31.35 
 
 
647 aa  128  2e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2560  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 
700 aa  128  2e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  9.81349e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1500  peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 
535 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1486  penicillin-binding protein transpeptidase  27.56 
 
 
551 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  29.2 
 
 
701 aa  127  4e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0919  peptidoglycan glycosyltransferase  28.95 
 
 
553 aa  127  4e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0272604  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0820  peptidoglycan glycosyltransferase  29.37 
 
 
705 aa  127  4e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0327  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 
557 aa  127  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.282636  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  27.05 
 
 
678 aa  126  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1801  penicillin-binding protein transpeptidase  35.19 
 
 
560 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  28.76 
 
 
662 aa  125  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  30.73 
 
 
660 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  30.18 
 
 
586 aa  124  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  30.61 
 
 
642 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1092  penicillin-binding protein 2  28.44 
 
 
618 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000952492  hitchhiker  1.09983e-07 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2482  peptidoglycan glycosyltransferase  28.12 
 
 
628 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.266047 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  27.81 
 
 
822 aa  124  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3317  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
618 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.42864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3453  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
618 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00243084  hitchhiker  0.00384932 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  30.16 
 
 
639 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3275  peptidoglycan glycosyltransferase  28.44 
 
 
618 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  2.07443e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0772  stage V sporulation protein D  28.16 
 
 
719 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.655623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>