More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1614 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 		 166 aa  344  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  62.5 
 
 		 162 aa  207  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.63 
 
 		 176 aa  201  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  56.88 
 
 		 200 aa  200  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  56.88 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  56.88 
 
 		 200 aa  198  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  60.65 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.82 
 
 		 164 aa  194  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.35 
 
 		 168 aa  195  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  60.13 
 
 		 175 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  58.94 
 
 		 169 aa  194  6e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.39 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.33 
 
 		 164 aa  193  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  58.44 
 
 		 168 aa  192  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  57.79 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.69 
 
 		 169 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  58.78 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  58.78 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  58.78 
 
 		 172 aa  189  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.730135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  56.76 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  56.76 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  56.76 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  56.76 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  58.78 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  58.78 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  56.76 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.33 
 
 		 175 aa  189  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  59.33 
 
 		 222 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.33 
 
 		 170 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  60 
 
 		 223 aa  188  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  59.33 
 
 		 174 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  56.76 
 
 		 178 aa  187  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  56.08 
 
 		 167 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  58.67 
 
 		 175 aa  187  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  56.08 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60 
 
 		 189 aa  184  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.95 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  54.67 
 
 		 155 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  57.04 
 
 		 182 aa  177  4.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  54.97 
 
 		 182 aa  177  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.17 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  58.67 
 
 		 252 aa  174  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  58.67 
 
 		 222 aa  175  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  56.16 
 
 		 164 aa  174  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  57.14 
 
 		 158 aa  173  7e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.97 
 
 		 163 aa  173  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  53.21 
 
 		 193 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3291  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  56.69 
 
 		 194 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.57 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  57.24 
 
 		 361 aa  167  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  57.24 
 
 		 361 aa  167  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  47.59 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  55.48 
 
 		 484 aa  166  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 		 152 aa  166  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.66 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  53.69 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  54.05 
 
 		 170 aa  164  4e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  53.42 
 
 		 148 aa  163  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  53.42 
 
 		 148 aa  163  8e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.91 
 
 		 475 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.61 
 
 		 461 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  54.42 
 
 		 149 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1675  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.67 
 
 		 197 aa  160  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000564994  normal  0.585232 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54 
 
 		 174 aa  160  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  49.32 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  51.37 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  53.74 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  53.06 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  57.35 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1496  tRNA-adenosine deaminase  50.67 
 
 		 195 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00298219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.1 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.33 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1037  tRNA-specific adenosine deaminase  54.84 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.97 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  49.03 
 
 		 189 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1017  tRNA-adenosine deaminase  56.93 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.251058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.11 
 
 		 150 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1216  tRNA-adenosine deaminase  51.91 
 
 		 151 aa  153  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0328  cytosine deaminase  49.66 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775757  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.97 
 
 		 411 aa  153  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  53.1 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.23 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  52.78 
 
 		 196 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.67 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.32 
 
 		 166 aa  151  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  46.06 
 
 		 177 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.68 
 
 		 363 aa  149  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.11 
 
 		 231 aa  150  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.39 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0025  tRNA-adenosine deaminase  49.31 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000596631  hitchhiker  0.00000110312 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.03 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.32 
 
 		 151 aa  148  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1589  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.32 
 
 		 190 aa  147  5e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139633  hitchhiker  0.0000269971 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  48.65 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 		 166 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>