274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0084 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  100 
 
 		 259 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0089  SmtA protein  56.84 
 
 		 199 aa  224  9e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  43.24 
 
 		 260 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  43.08 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  39.92 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  42.37 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  39.92 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  39.92 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  39.92 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  39.92 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  39.84 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  40.8 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  40.8 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2185  putative metallothionein SmtA  39.93 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.166203  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  38.91 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  39.46 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  39.45 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  38.67 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  40.64 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  38.43 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  39.77 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  40.31 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  39.36 
 
 		 249 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  38.15 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  36.76 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  40.64 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  40.64 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  37.9 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  40.64 
 
 		 249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  37.21 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  34.88 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  35.14 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  34.65 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1725  methyltransferase type 11  37.59 
 
 		 295 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.347892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  34.25 
 
 		 254 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1544  methyltransferase  35.93 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.468935 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2560  SmtA protein  34.14 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  34.98 
 
 		 262 aa  145  8.000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  32.94 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0740  smtA protein  35.14 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01900  SAM-dependent methyltransferase  29.88 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.144635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  26.2 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  27.39 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  25.74 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  25.69 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  28.84 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  23.89 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  24.78 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.98 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.71 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  24.62 
 
 		 252 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.01 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0574  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.44 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.36 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.62 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.87 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.81 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.61 
 
 		 236 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>