More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2088 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2088  signal peptidase I  100 
 
 		 269 aa  546  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2027  signal peptidase I  62.78 
 
 		 262 aa  332  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0626675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1752  peptidase S26A, signal peptidase I  60 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0861  signal peptidase I  57.62 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0146841 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1005  signal peptidase I  57.62 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0514766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2314  signal peptidase I  61.13 
 
 		 262 aa  306  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.376874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0926  signal peptidase I  54.33 
 
 		 297 aa  305  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0991  signal peptidase I  53.97 
 
 		 297 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0050867  normal  0.048804 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1061  signal peptidase I  52.29 
 
 		 305 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2254  signal peptidase I  52.82 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2420  signal peptidase I  51.83 
 
 		 299 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133024  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1091  signal peptidase I  50.5 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.5937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0653  peptidase S26A, signal peptidase I  50.5 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1133  signal peptidase I  50.5 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2171  signal peptidase I  49.83 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4245  signal peptidase I  50.17 
 
 		 297 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.990616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1013  signal peptidase I  50.17 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1009  signal peptidase I  50.17 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0600  signal peptidase I  50.67 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000224318 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1729  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509691  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1465  signal peptidase I  52.17 
 
 		 262 aa  275  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0648  signal peptidase I  50.17 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0465019  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0412  signal peptidase I  52.96 
 
 		 268 aa  275  6e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2780  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0542  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2896  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2814  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1790  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2841  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2467  signal peptidase I  51.83 
 
 		 297 aa  275  8e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0405  signal peptidase I  53.87 
 
 		 268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5263  signal peptidase I  50.5 
 
 		 325 aa  271  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1194  signal peptidase I  57.85 
 
 		 324 aa  271  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.992009  decreased coverage  0.00558378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2900  signal peptidase I  49.83 
 
 		 297 aa  269  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185771  normal  0.669107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3637  signal peptidase I  49.33 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.034698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1400  signal peptidase I  51.01 
 
 		 321 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3240  signal peptidase I  55.19 
 
 		 342 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.80129  normal  0.013129 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1084  signal peptidase I  49.83 
 
 		 297 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.365204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0840  signal peptidase I  49.5 
 
 		 297 aa  265  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00439997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1741  peptidase S26A, signal peptidase I  48.16 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0212318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1090  signal peptidase I  50.18 
 
 		 267 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.21498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3269  signal peptidase I  47.16 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0671154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3063  signal peptidase I  48.33 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0636923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2622  signal peptidase I  46.82 
 
 		 322 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1949  signal peptidase I  48.73 
 
 		 256 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1390  signal peptidase I  48.79 
 
 		 266 aa  255  4e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2460  peptidase S26A, signal peptidase I  46.9 
 
 		 270 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1119  signal peptidase I  50.58 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1398  signal peptidase I  50.58 
 
 		 263 aa  248  6e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1630  signal peptidase I  48.03 
 
 		 267 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0207153  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1836  Signal peptidase I  46.55 
 
 		 251 aa  240  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1833  Signal peptidase I  46.91 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1473  signal peptidase I  47.52 
 
 		 284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0733  peptidase S26A, signal peptidase I  46.91 
 
 		 255 aa  238  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000686529  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4751  signal peptidase I  45.72 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0616225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54350  signal peptidase I  45.39 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3953  Signal peptidase I  44.92 
 
 		 284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4219  signal peptidase I  44.92 
 
 		 284 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0233251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1432  signal peptidase I  51.68 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0993  signal peptidase I  49.8 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4289  signal peptidase I  51.68 
 
 		 284 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2247  signal peptidase I  46.15 
 
 		 263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13750  signal peptidase I  50.39 
 
 		 283 aa  225  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4375  signal peptidase I  51.26 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.272416 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1242  signal peptidase I  43.79 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000742839  unclonable  0.0000000149917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1147  Signal peptidase I  44.56 
 
 		 305 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000185511  normal  0.576512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2930  signal peptidase I  44.72 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1687  signal peptidase I  40.29 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0480  signal peptidase I  40.29 
 
 		 256 aa  223  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002496  signal peptidase I  43.51 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0519159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1072  signal peptidase I  50.84 
 
 		 284 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2767  peptidase S26A, signal peptidase I  44.98 
 
 		 304 aa  221  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000572836  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1036  signal peptidase I  42.76 
 
 		 305 aa  219  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00141491  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03537  signal peptidase  42.11 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0879  Signal peptidase I  44.1 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510509  normal  0.115217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1245  signal peptidase I  41.9 
 
 		 274 aa  215  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.181866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1053  signal peptidase I  43.3 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1200  signal peptidase I  41.92 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00231216  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1244  signal peptidase I  41.92 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000321734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3113  signal peptidase I  41.92 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00010376  normal  0.0138648 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1277  signal peptidase I  41.92 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0693352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2849  signal peptidase I  40.7 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0206128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2931  signal peptidase I  40.7 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3027  signal peptidase I  40.7 
 
 		 305 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000684552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1158  signal peptidase I  42.11 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1345  signal peptidase I  44.8 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.150454  normal  0.782452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02999  signal peptidase I  42.86 
 
 		 300 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.406201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2040  signal peptidase I  41.2 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0825162  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0331  signal peptidase I  41.79 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2462  peptidase S26A, signal peptidase I  41.18 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1347  signal peptidase I  41.32 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1373  signal peptidase I  42.91 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0365  peptidase S26A, signal peptidase I  41.79 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3150  signal peptidase I  43.06 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000379573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1442  Signal peptidase I  42.91 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01715  signal peptidase I  42.61 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3670  signal peptidase I  40.07 
 
 		 325 aa  202  5e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2526  signal peptidase I (leader peptidase I)  42.66 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0283141  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0639  signal peptidase I  45.08 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.602306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2933  signal peptidase I  41.35 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.173201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>