More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0990 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  100 
 
 		 349 aa  721    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  71.6 
 
 		 337 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  62.54 
 
 		 326 aa  431  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  64.22 
 
 		 333 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  57.6 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  59.87 
 
 		 333 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  59.55 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  59.24 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  59.55 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  56.33 
 
 		 334 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  58.68 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  60.06 
 
 		 334 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  58.68 
 
 		 374 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  58.07 
 
 		 332 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  57.14 
 
 		 332 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  57.96 
 
 		 335 aa  391  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  57.41 
 
 		 372 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  55.1 
 
 		 333 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  54.14 
 
 		 333 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 		 347 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  47.65 
 
 		 355 aa  299  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  47.19 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  47.19 
 
 		 350 aa  295  7e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  45.51 
 
 		 345 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  44.97 
 
 		 355 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  45.45 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  46.2 
 
 		 353 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  45.31 
 
 		 349 aa  285  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  46.11 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  46.11 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  43.11 
 
 		 340 aa  282  6.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  41.11 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  44.35 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  42.81 
 
 		 347 aa  268  8e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  44.72 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  39.94 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  40.94 
 
 		 346 aa  265  7e-70  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  41.92 
 
 		 337 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.88 
 
 		 336 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2289  extracellular solute-binding protein  41.35 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  39.56 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  39.57 
 
 		 336 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  41.18 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  39.44 
 
 		 348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  42.33 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1056  extracellular solute-binding protein  41.64 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835874  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  41.77 
 
 		 341 aa  251  9.000000000000001e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  40.52 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  39.13 
 
 		 346 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1610  extracellular solute-binding protein  41.82 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00405926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3092  extracellular solute-binding protein  41.46 
 
 		 352 aa  246  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00849212  normal  0.375383 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  38.82 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  40.5 
 
 		 336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  37.5 
 
 		 349 aa  246  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  40.44 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2758  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 		 347 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181201  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  39 
 
 		 337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  41.37 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0115  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  37.31 
 
 		 335 aa  242  7.999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  38.53 
 
 		 337 aa  242  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  37.84 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1371  putative iron binding protein component of ABC iron transporter  39.88 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4743  extracellular solute-binding protein  37.68 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.326241  normal  0.358869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  40.06 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  39.05 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2866  extracellular solute-binding protein  39.5 
 
 		 351 aa  239  5e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1181  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic ligand binding protein  40.18 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0582814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  38.44 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  38.46 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  39.52 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  39.75 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  39.7 
 
 		 335 aa  237  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  39.08 
 
 		 335 aa  236  4e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  40.99 
 
 		 348 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2553  extracellular solute-binding protein  40.12 
 
 		 372 aa  236  6e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000043545  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1607  extracellular solute-binding protein  39.82 
 
 		 349 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  40.81 
 
 		 349 aa  235  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2107  extracellular solute-binding protein family 1  39.76 
 
 		 347 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  41.25 
 
 		 347 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  41.23 
 
 		 362 aa  232  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  41.07 
 
 		 347 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  40.75 
 
 		 347 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  37.94 
 
 		 380 aa  229  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0967  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 353 aa  230  4e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  37.88 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  38.58 
 
 		 335 aa  229  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0976  extracellular solute-binding protein family 1  37.06 
 
 		 336 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  38.37 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 347 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 347 aa  229  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  40.75 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>