More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0144 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  100 
 
 
352 aa  709    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  47.08 
 
 
354 aa  325  7e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  44.44 
 
 
351 aa  315  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  49.42 
 
 
360 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  45.59 
 
 
341 aa  298  1e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  48.33 
 
 
350 aa  296  3e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  45.29 
 
 
349 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  43.1 
 
 
352 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  42.86 
 
 
345 aa  286  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  49.08 
 
 
350 aa  285  8e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  50.52 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  52.53 
 
 
370 aa  281  9e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  48.97 
 
 
347 aa  279  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  48.63 
 
 
347 aa  278  8e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  44.89 
 
 
344 aa  278  1e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  41.4 
 
 
353 aa  271  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  45.68 
 
 
348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  44.41 
 
 
348 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  39.3 
 
 
346 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  45.65 
 
 
348 aa  263  4e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  42.25 
 
 
372 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  39.42 
 
 
345 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  40.57 
 
 
356 aa  255  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  41.8 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  41.93 
 
 
357 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  40.98 
 
 
351 aa  241  1e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
380 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 
374 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  39.76 
 
 
337 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  44.48 
 
 
360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  37.35 
 
 
359 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  43.65 
 
 
323 aa  228  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  45.02 
 
 
331 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  37.3 
 
 
359 aa  225  9e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  36.77 
 
 
359 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  42.65 
 
 
311 aa  219  6e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  39.88 
 
 
337 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  36.62 
 
 
364 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  29.36 
 
 
350 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
365 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 
368 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  22.61 
 
 
341 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.57 
 
 
473 aa  92.8  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.22 
 
 
473 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  25.78 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  21.97 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  22.29 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.67 
 
 
329 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  22.46 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  26.55 
 
 
351 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.73 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  26.74 
 
 
474 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.2 
 
 
481 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  25.33 
 
 
329 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  25.17 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  23.53 
 
 
344 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  27.62 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  27.47 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  26.2 
 
 
368 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  25.67 
 
 
328 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  25.67 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.32 
 
 
487 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.76 
 
 
470 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  23.88 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.57 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  27.76 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  24.22 
 
 
352 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  26.69 
 
 
340 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.15 
 
 
491 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  27.45 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.39 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  28.33 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.76 
 
 
466 aa  72  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.65 
 
 
471 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  24.22 
 
 
352 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.01 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  23.53 
 
 
346 aa  70.5  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.52 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  24.51 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  27.13 
 
 
344 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.29 
 
 
469 aa  70.1  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.31 
 
 
469 aa  69.3  0.00000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  25.89 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.29 
 
 
367 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.19 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.91 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  24.22 
 
 
352 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  22.81 
 
 
367 aa  68.6  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.24 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  23.31 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.98 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  22.79 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  24.81 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>