134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3471 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3471  hydroxypyruvate reductase  100 
 
 		 420 aa  816    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.500752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2195  hydroxypyruvate reductase  50.12 
 
 		 408 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0384418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0944  Hydroxypyruvate reductase  45.45 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0451317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1207  hydroxypyruvate reductase  39.01 
 
 		 417 aa  237  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00103634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1248  hydroxypyruvate reductase  39.01 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1253  hydroxypyruvate reductase  37.47 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000356699  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0207  hydroxypyruvate reductase  37.59 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3921  Hydroxypyruvate reductase  40.6 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2615  hydroxypyruvate reductase  43.77 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1644  Hydroxypyruvate reductase  39.67 
 
 		 421 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.265451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0534  hydroxypyruvate reductase  32.86 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0143531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3294  glycerate 2-kinase  43.45 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805027  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1573  hydroxypyruvate reductase  41.81 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0993833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1595  glycerate 2-kinase  37.91 
 
 		 424 aa  212  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00618023  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4311  hydroxypyruvate reductase  39.71 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0996892 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2329  hydroxypyruvate reductase  38.63 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.162481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0976  hydroxypyruvate reductase  40.71 
 
 		 429 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0906913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3389  Hydroxypyruvate reductase  43.27 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1113  hydroxypyruvate reductase  42.13 
 
 		 448 aa  208  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3154  Hydroxypyruvate reductase  41.6 
 
 		 439 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.941324 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1449  hydroxypyruvate reductase oxidoreductase protein  40.24 
 
 		 446 aa  206  5e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.618251  normal  0.42713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3451  glycerate 2-kinase  40.62 
 
 		 443 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3865  hydroxypyruvate reductase  38.08 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.36576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4300  hydroxypyruvate reductase  38.08 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1434  hydroxypyruvate reductase  38.52 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3625  hydroxypyruvate reductase  37.85 
 
 		 424 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1122  hydroxypyruvate reductase  40.37 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.468975  normal  0.520204 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1233  glycerate 2-kinase  37.21 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1715  Hydroxypyruvate reductase  41.03 
 
 		 421 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.497663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3481  Hydroxypyruvate reductase  39.61 
 
 		 439 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.866282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2115  hydroxypyruvate reductase  38.89 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2309  hydroxypyruvate reductase  37.53 
 
 		 426 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.866459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1569  hydroxypyruvate reductase  38.08 
 
 		 424 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1319  hydroxypyruvate reductase  41.84 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1721  hydroxypyruvate reductase  40.47 
 
 		 447 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.374264  normal  0.0199208 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1042  Hydroxypyruvate reductase  40.41 
 
 		 440 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9119  hydroxypyruvate reductase  39.95 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3263  glycerate 2-kinase  39.58 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2103  hydroxypyruvate reductase  35 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1502  Hydroxypyruvate reductase  35.53 
 
 		 446 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3177  hydroxypyruvate reductase  39.54 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1018  hydroxypyruvate reductase  38.69 
 
 		 448 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.49104  normal  0.460124 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0085  hydroxypyruvate reductase  30.33 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1461  Hydroxypyruvate reductase  38.75 
 
 		 424 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012769  normal  0.0639524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1111  hydroxypyruvate reductase  32.87 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.961432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1997  hydroxypyruvate reductase  41.71 
 
 		 458 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05256 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5562  hydroxypyruvate reductase  36.78 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.912561  normal  0.104542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3104  hydroxypyruvate reductase  37.41 
 
 		 418 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.561288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2118  glycerate 2-kinase  36.28 
 
 		 426 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0806  Hydroxypyruvate reductase  40.72 
 
 		 496 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0099  Hydroxypyruvate reductase  37.06 
 
 		 443 aa  192  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2854  glycerate 2-kinase  40.23 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3915  MOFRL domain-containing protein  36.14 
 
 		 443 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2751  glycerate 2-kinase  37.28 
 
 		 486 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1425  Hydroxypyruvate reductase  38.79 
 
 		 424 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3926  hydroxypyruvate reductase  38.01 
 
 		 407 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2209  hydroxypyruvate reductase  39.86 
 
 		 444 aa  189  8e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2801  Hydroxypyruvate reductase  38.01 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3163  hydroxypyruvate reductase  38.77 
 
 		 423 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2839  MOFRL  38.19 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3717  Hydroxypyruvate reductase  35.57 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3833  hypothetical protein  38.66 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3272  hydroxypyruvate reductase  42.57 
 
 		 458 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.571627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2464  hydroxypyruvate reductase  42.66 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2205  hydroxypyruvate reductase  37.44 
 
 		 454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.870447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3609  MOFRL domain protein  35.39 
 
 		 419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45030  hypothetical protein  38.37 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2772  glycerate 2-kinase  38.57 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0569344  normal  0.431109 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0472  hydroxypyruvate reductase  34.2 
 
 		 442 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.488589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0461  hydroxypyruvate reductase  36.99 
 
 		 424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38588  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0355  hydroxypyruvate reductase, putative  35.87 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0372  putative hydroxypyruvate reductase  35.87 
 
 		 448 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.236389  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0816  hydroxypyruvate reductase  33.11 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0928  hydroxypyruvate reductase  37.13 
 
 		 460 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4629  hydroxypyruvate reductase  42.23 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03376  Hydroxypyruvate reductase  34.96 
 
 		 409 aa  176  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2372  hydroxypyruvate reductase  42.23 
 
 		 424 aa  176  9e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.137273  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2454  Hydroxypyruvate reductase  36.09 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1267  hydroxypyruvate reductase  40.59 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.315917  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3046  Hydroxypyruvate reductase  39.14 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.418895  normal  0.698329 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2759  Hydroxypyruvate reductase  40.76 
 
 		 317 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4659  Hydroxypyruvate reductase  38.85 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0604  Glycerate kinase  33.69 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1160  hydroxypyruvate reductase  37.91 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.370064  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3797  hydroxypyruvate reductase  41.09 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.430898  normal  0.277754 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3906  hypothetical protein  40.56 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.394161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0654  MOFRL domain protein  38.25 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56499  predicted protein  38.32 
 
 		 625 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4017  hydroxypyruvate reductase  36.13 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5964  MOFRL domain protein  37.2 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1889  hydroxypyruvate reductase  34.6 
 
 		 450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000303684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0377  Hydroxypyruvate reductase  37.35 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.487635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0248  MOFRL domain-containing protein  33.49 
 
 		 376 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0405  MOFRL  38.34 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0774334 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0126  hydroxypyruvate reductase  37.41 
 
 		 439 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2974  Hydroxypyruvate reductase  35.68 
 
 		 437 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.845005 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0452  MOFRL domain-containing protein  37.5 
 
 		 456 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3775  MOFRL domain-containing protein  41.42 
 
 		 413 aa  162  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.801472  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3071  putative hydroxypyruvate reductase/glycerate kinase  41.76 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0336  hydroxypyruvate reductase  34.47 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>