More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2552 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2552  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 282 aa  341  9e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 283 aa  337  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 283 aa  337  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  57.65 
 
 		 283 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 290 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  57.3 
 
 		 283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 283 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  58.21 
 
 		 288 aa  331  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 283 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  56.23 
 
 		 283 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  55.71 
 
 		 283 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0786  formyltetrahydrofolate deformylase  57.24 
 
 		 316 aa  323  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  53.43 
 
 		 282 aa  322  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  54.8 
 
 		 285 aa  323  3e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  56.79 
 
 		 287 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0584  formyltetrahydrofolate deformylase  54.9 
 
 		 291 aa  320  9.999999999999999e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  55.87 
 
 		 296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  53.21 
 
 		 284 aa  319  3e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  51.93 
 
 		 286 aa  316  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0056  formyltetrahydrofolate deformylase  53.5 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.333172  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 287 aa  311  5.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.57 
 
 		 283 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02600  formyltetrahydrofolate deformylase  53.12 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.304695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6765  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 291 aa  305  8.000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3654  formyltetrahydrofolate deformylase  51.55 
 
 		 290 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4965  formyltetrahydrofolate deformylase  53.15 
 
 		 289 aa  298  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  51.08 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  52.67 
 
 		 289 aa  280  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  50.9 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1883  formyltetrahydrofolate deformylase  52.11 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0189555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 282 aa  278  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 284 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4789  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 285 aa  272  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 282 aa  271  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 284 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  50.54 
 
 		 309 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 285 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 300 aa  266  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 284 aa  266  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 287 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 284 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 		 284 aa  265  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00467  formyltetrahydrofolate deformylase  48.69 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  48.26 
 
 		 284 aa  263  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  48.96 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 287 aa  262  4e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  48.55 
 
 		 282 aa  261  8.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2993  formyltetrahydrofolate deformylase  50.55 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  48.4 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  47.29 
 
 		 282 aa  259  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3853  formyltetrahydrofolate deformylase  47.72 
 
 		 287 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.565594  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1153  formyltetrahydrofolate deformylase  47.31 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.677496  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5699  formyltetrahydrofolate deformylase  48.23 
 
 		 287 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 287 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03765  formyltetrahydrofolate deformylase  50.78 
 
 		 263 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7341  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 		 284 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0997377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2841  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2699  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 		 294 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.622702  normal  0.252245 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  46.69 
 
 		 294 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 287 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1100  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.862849  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3470  formyltetrahydrofolate deformylase  46.43 
 
 		 288 aa  256  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3290  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.38752 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2544  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 282 aa  255  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.553017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 286 aa  255  5e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3621  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 284 aa  255  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.155921  normal  0.0233728 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3457  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  45.99 
 
 		 294 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28050  formyltetrahydrofolate deformylase  49.09 
 
 		 302 aa  255  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0961827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3983  formyltetrahydrofolate deformylase  48.25 
 
 		 285 aa  255  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.523347 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  46.34 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 284 aa  254  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4704  formyltetrahydrofolate deformylase  48.21 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452468  normal  0.348836 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0213  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.543031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1081  formyltetrahydrofolate deformylase  48.74 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1192  formyltetrahydrofolate deformylase  45.04 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  45.71 
 
 		 282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5200  formyltetrahydrofolate deformylase  47.14 
 
 		 281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.569737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0941  formyltetrahydrofolate deformylase  49.46 
 
 		 283 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.417344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  48.04 
 
 		 288 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2613  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.705504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4904  formyltetrahydrofolate deformylase  46.79 
 
 		 294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0944  formyltetrahydrofolate deformylase  46.62 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>