More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2493 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 350 aa  713    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  69.69 
 
 		 331 aa  456  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  62.61 
 
 		 329 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  58.75 
 
 		 338 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  59.87 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  58.48 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  60.12 
 
 		 327 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  56.39 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  58.33 
 
 		 326 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  59.01 
 
 		 328 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  55.73 
 
 		 328 aa  381  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  60 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  56.44 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  59.88 
 
 		 330 aa  378  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  58.88 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  58.57 
 
 		 329 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  57.28 
 
 		 330 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  55.99 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  58.95 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  59.19 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  59.5 
 
 		 330 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  59.19 
 
 		 330 aa  361  8e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  57.63 
 
 		 331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0529  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 341 aa  355  5.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00475144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  55.73 
 
 		 332 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  57.32 
 
 		 330 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  55.45 
 
 		 329 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  56.79 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1148  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 328 aa  349  3e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.602539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  57.45 
 
 		 330 aa  348  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0590  UDP-glucose 4-epimerase  51.52 
 
 		 328 aa  348  9e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  52.94 
 
 		 337 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1273  UDP-glucose 4-epimerase  51.22 
 
 		 328 aa  347  1e-94  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  58.51 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  52.94 
 
 		 336 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  53.42 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 		 327 aa  345  6e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4998  UDP-glucose 4-epimerase  54.15 
 
 		 330 aa  344  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163773  normal  0.0224202 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  55.45 
 
 		 327 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1224  UDP-glucose 4-epimerase  51.21 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00236591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  53.25 
 
 		 337 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  57.41 
 
 		 322 aa  342  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 328 aa  342  7e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  51.03 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0464  UDP-glucose 4-epimerase  50.91 
 
 		 327 aa  340  2e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0781477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  55.9 
 
 		 339 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  55.14 
 
 		 344 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  54.83 
 
 		 344 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  51.39 
 
 		 337 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 		 336 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0168  UDP-glucose 4-epimerase  56.07 
 
 		 342 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.566405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  51.08 
 
 		 337 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  53.09 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 323 aa  332  7.000000000000001e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  53.58 
 
 		 326 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  53.42 
 
 		 333 aa  328  7e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  52.96 
 
 		 320 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0783  UDP-glucose 4-epimerase  48.94 
 
 		 329 aa  323  4e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297847  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1392  UDP-glucose 4-epimerase  47.88 
 
 		 330 aa  322  8e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.65 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.22 
 
 		 331 aa  320  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  51.24 
 
 		 323 aa  318  7.999999999999999e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 		 333 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  51.7 
 
 		 338 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.79 
 
 		 327 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 332 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  48.45 
 
 		 337 aa  311  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  48.14 
 
 		 337 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 321 aa  309  5e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  46.42 
 
 		 326 aa  309  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  48.45 
 
 		 332 aa  308  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 329 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  48.76 
 
 		 332 aa  306  3e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 		 326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  47.83 
 
 		 330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 		 329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1618  UDP-galactose 4-epimerase  52.32 
 
 		 350 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  46.58 
 
 		 332 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 324 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  50.76 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.35 
 
 		 334 aa  299  4e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  47.15 
 
 		 354 aa  298  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  47.98 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.02 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 330 aa  296  4e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 329 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  49.04 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 325 aa  295  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  49.05 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  49.05 
 
 		 327 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  46.25 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>