37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0037 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0037  AbrB family transcriptional regulator  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000106166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1976  regulators of stationary/sporulation gene expression  49.38 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1619  AbrB family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 90 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4882  AbrB family transcriptional regulator  48 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2869  AbrB family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0693  transcriptional regulator, AbrB family  54.55 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.747967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4189  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 105 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47354  normal  0.440308 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5677  AbrB family transcriptional regulator  36 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3606  Regulators of stationary/sporulation gene expression protein  48.98 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3434  AbrB family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.838817  normal  0.246691 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0660  AbrB family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0622  transcriptional regulator, AbrB family  38.46 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.758267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0720  transcriptional regulator, AbrB family  35.8 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.032212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6993  AbrB family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1206  transcriptional regulator, AbrB family  51.22 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000319684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1697  AbrB family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311866  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2925  transcriptional regulator, AbrB family  52.94 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.621322  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0068  AbrB family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.499892  normal  0.748318 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2400  transcriptional regulator, AbrB family  47.37 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.303148  hitchhiker  0.00489815 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1276  transcriptional regulator, AbrB family  51.35 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3255  transcriptional regulator, AbrB family  50 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0407  AbrB family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000503263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0976  transcriptional regulator, AbrB family  37.78 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.73143  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2744  transcriptional regulator, AbrB family  51.16 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.909069  normal  0.461653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2444  hypothetical protein  63.33 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2596  AbrB family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 79 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567347  normal  0.158945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3733  transcriptional regulator, AbrB family  40 
 
 		 84 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0338094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1166  AbrB family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 102 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000565949  normal  0.132039 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1648  AbrB family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.756068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1174  AbrB family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0376  AbrB family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.914517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1246  AbrB family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.882572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3502  transcriptional regulator AbrB  47.5 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2685  transcriptional regulator, AbrB family  35.62 
 
 		 78 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.561513  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24980  looped-hinge helix DNA binding domain, AbrB family  40.91 
 
 		 85 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3177  AbrB family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 94 aa  40  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0687  AbrB family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 92 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000068736  unclonable  0.00000000733097 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>