More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0095 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  100 
 
 
226 aa  465  9.999999999999999e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.87 
 
 
235 aa  216  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2353  phosphoglyceromutase  46.67 
 
 
233 aa  203  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2593  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.79 
 
 
227 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  47.93 
 
 
210 aa  199  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  43.98 
 
 
201 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  44.49 
 
 
207 aa  188  8e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  45.28 
 
 
207 aa  185  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 
207 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  44.05 
 
 
207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  40.89 
 
 
213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  44.55 
 
 
211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  45.02 
 
 
211 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
211 aa  180  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  44.69 
 
 
207 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  45.5 
 
 
206 aa  180  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  45.24 
 
 
211 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  38.82 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2490  phosphoglyceromutase  40.74 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2442  phosphoglyceromutase  40.74 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  45.54 
 
 
208 aa  178  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  46.23 
 
 
206 aa  177  9e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  44.08 
 
 
208 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1172  phosphoglyceromutase  37.45 
 
 
230 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000600648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40.83 
 
 
249 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  42.65 
 
 
212 aa  175  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  46.19 
 
 
206 aa  174  9e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0764  phosphoglyceromutase  36.63 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00177418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  38.75 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  39.58 
 
 
247 aa  172  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  41.42 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  37.92 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  38.93 
 
 
247 aa  172  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  39.42 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  40.08 
 
 
229 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  40.17 
 
 
234 aa  170  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
228 aa  171  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2007  phosphoglyceromutase  39.2 
 
 
228 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.980776  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  40.08 
 
 
249 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  40.5 
 
 
248 aa  169  4e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  37.45 
 
 
253 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  43.13 
 
 
206 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  37.86 
 
 
248 aa  168  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  38.91 
 
 
248 aa  168  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  38.08 
 
 
246 aa  168  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  42.65 
 
 
212 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  37.86 
 
 
249 aa  167  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  42.65 
 
 
212 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  38.4 
 
 
246 aa  167  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  42.65 
 
 
212 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 
248 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1323  phosphoglyceromutase  38.75 
 
 
232 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  37.55 
 
 
246 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 
248 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  40.81 
 
 
204 aa  166  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
206 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  40.25 
 
 
228 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  38.98 
 
 
248 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  43.6 
 
 
206 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6753  phosphoglycerate mutase 1 family  37.66 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.969111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  39.15 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  37.77 
 
 
248 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  38.49 
 
 
248 aa  165  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  39.09 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  37.3 
 
 
250 aa  164  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  36.1 
 
 
333 aa  164  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  37.55 
 
 
251 aa  164  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  37.19 
 
 
246 aa  164  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  39.17 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  36.48 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  37.7 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2961  phosphoglycerate mutase  36.12 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184565  normal  0.0787662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0167  phosphoglyceromutase  36.07 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000351468  hitchhiker  1.89085e-19 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  36.48 
 
 
250 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1264  phosphoglyceromutase  38.52 
 
 
230 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.500435  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  36.48 
 
 
250 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  36.48 
 
 
250 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  36.48 
 
 
250 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  38.14 
 
 
248 aa  163  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  37.86 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  37.66 
 
 
248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  36.48 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  36.89 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  38.33 
 
 
251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  38.02 
 
 
249 aa  161  6e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 
237 aa  161  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  37.3 
 
 
250 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  39.33 
 
 
247 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  36.63 
 
 
248 aa  161  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1794  phosphoglyceromutase  37.45 
 
 
245 aa  161  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.525097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>