More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12393 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12393  putative metalloprotease  100 
 
 
182 aa  367  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2707  putative metalloprotease  90.34 
 
 
178 aa  325  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3831  putative metalloprotease  89.2 
 
 
184 aa  324  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3455  putative metalloprotease  88.07 
 
 
177 aa  320  8e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3466  putative metalloprotease  88.07 
 
 
177 aa  320  8e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3518  putative metalloprotease  88.07 
 
 
177 aa  320  8e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.580831 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13590  putative metalloprotease  65.68 
 
 
183 aa  222  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.85661  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3158  protein of unknown function UPF0054  60.92 
 
 
188 aa  222  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0124232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1250  putative metalloprotease  62.72 
 
 
187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2761  protein of unknown function UPF0054  65.71 
 
 
179 aa  205  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.273254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1577  protein of unknown function UPF0054  66.45 
 
 
186 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.15724  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2205  protein of unknown function UPF0054  63.16 
 
 
150 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.852425  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2187  protein of unknown function UPF0054  63.87 
 
 
153 aa  190  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.838874  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0790  putative metalloprotease  58.54 
 
 
164 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.118605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1659  protein of unknown function UPF0054  61.33 
 
 
167 aa  185  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7048  protein of unknown function UPF0054  60.26 
 
 
159 aa  185  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2296  protein of unknown function UPF0054  61.44 
 
 
160 aa  184  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3246  protein of unknown function UPF0054  59.6 
 
 
156 aa  182  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00843166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1157  hypothetical protein  59.73 
 
 
156 aa  182  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0845  putative metalloprotease  59.46 
 
 
155 aa  180  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.673437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1751  protein of unknown function UPF0054  63.82 
 
 
150 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0992531  normal  0.35985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13480  conserved hypothetical protein TIGR00043  58.55 
 
 
153 aa  177  8e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0978082 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3831  putative metalloprotease  60.26 
 
 
170 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0226869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0708  protein of unknown function UPF0054  59.06 
 
 
162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.659957  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3452  putative metalloprotease  60.93 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.90902  normal  0.113177 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3386  putative metalloprotease  57.79 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.581061 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2231  putative metalloprotease  57.89 
 
 
157 aa  170  9e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0010051  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4626  hypothetical protein  55.33 
 
 
156 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1545  protein of unknown function UPF0054  55.33 
 
 
151 aa  166  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1968  putative metalloprotease  54.84 
 
 
157 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000419167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2113  putative metalloprotease  54.67 
 
 
159 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11740  conserved hypothetical protein TIGR00043  56 
 
 
166 aa  159  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.372273  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1268  putative metalloprotease  54 
 
 
201 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.16283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1913  putative metalloprotease  53.33 
 
 
149 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.665718  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17240  conserved hypothetical protein TIGR00043  55.92 
 
 
153 aa  156  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17416  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0863  metalloprotein, YbeY family  51.72 
 
 
186 aa  149  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12330  conserved hypothetical protein TIGR00043  59.86 
 
 
157 aa  144  9e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.37516  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0595  putative metalloprotease  50 
 
 
182 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1137  hypothetical protein  40 
 
 
155 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1983  protein of unknown function UPF0054  48.21 
 
 
157 aa  98.2  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12580  conserved hypothetical protein TIGR00043  35.33 
 
 
142 aa  96.7  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1662  hypothetical protein  34.44 
 
 
155 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1628  hypothetical protein  34.44 
 
 
155 aa  95.9  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1270  protein of unknown function UPF0054  37.11 
 
 
181 aa  91.7  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0330  protein of unknown function UPF0054  36.36 
 
 
446 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1274  protein of unknown function UPF0054  40 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4154  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  89  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1564  metal-dependent hydrolase  37.98 
 
 
156 aa  89.4  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4383  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0322073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2046  cytidine deaminase  45.45 
 
 
301 aa  88.2  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0816  putative metalloprotease  39.01 
 
 
156 aa  87.8  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000207338  decreased coverage  7.68731e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4202  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410941  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4040  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000190602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4050  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000368006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4527  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.134692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4325  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.55904e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4436  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000173642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1069  hypothetical protein  40.17 
 
 
162 aa  87.4  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.366774  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1151  hypothetical protein  38.97 
 
 
160 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000970486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4420  putative metalloprotease  38.24 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1186  putative metalloprotease  34.59 
 
 
162 aa  85.9  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.685127  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0576  protein of unknown function UPF0054  40.68 
 
 
161 aa  84.3  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3029  putative metalloprotease  37.39 
 
 
156 aa  84.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.125459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4278  protein of unknown function UPF0054  41.18 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1181  hypothetical protein  39.26 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000026946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2424  putative metalloprotease  38.14 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2444  hypothetical protein  48.31 
 
 
166 aa  82.4  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  39.47 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1026  putative metalloprotease  39.5 
 
 
156 aa  82  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0561  conserved hypothetical protein TIGR00043  33.59 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.490127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0254  protein of unknown function UPF0054  30.5 
 
 
152 aa  81.6  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  41.44 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07650  conserved hypothetical protein TIGR00043  37.04 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.78316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0595  hypothetical protein  41.67 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1370  hypothetical protein  38.52 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000384881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  38.82 
 
 
185 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0530  protein of unknown function UPF0054  31.25 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0793  protein of unknown function UPF0054  32.72 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000213383  normal  0.532433 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  39.82 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  38.39 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0736  hypothetical protein  32.31 
 
 
159 aa  78.2  0.00000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.682794  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2126  hypothetical protein  42.74 
 
 
180 aa  77.8  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3068  putative metalloprotease  40.4 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00524874  decreased coverage  0.00000007454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4283  hypothetical protein  41.88 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.519961  normal  0.0570466 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl265  putative metal-dependent hydrolase  33.55 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.85066e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2609  hypothetical protein  31.91 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1395  hypothetical protein  35.37 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1601  hypothetical protein  35.37 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0846  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1501  putative metalloprotease  33.06 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.236796  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0508  hypothetical protein  28.19 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0103384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0666  putative metalloprotease  30.49 
 
 
165 aa  74.7  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02001  metal-dependent hydrolase  35.09 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  33.99 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0184  hypothetical protein  35.78 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0937596  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02111  metal-dependent hydrolase  31.01 
 
 
135 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  37.84 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02001  metal-dependent hydrolase  35.78 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  hitchhiker  0.00774291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>