More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1836 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1836  putative glycerol-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 		 529 aa  1065    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.399827  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0499  glycerol-3-phosphate oxidase  72.4 
 
 		 525 aa  757    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0717318  normal  0.0321239 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  42.63 
 
 		 531 aa  319  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0871  FAD dependent oxidoreductase  40.3 
 
 		 537 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.633579 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  41.87 
 
 		 532 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  40.11 
 
 		 537 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  38.82 
 
 		 545 aa  299  9e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 		 539 aa  293  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 548 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 		 542 aa  279  8e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  34.62 
 
 		 700 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  37.2 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.03 
 
 		 530 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2005  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 543 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.758416  normal  0.433601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  37.13 
 
 		 516 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  38.87 
 
 		 529 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  36.85 
 
 		 519 aa  249  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 552 aa  247  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04310  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  36.27 
 
 		 798 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68764  mitochondrial glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.15 
 
 		 640 aa  243  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 543 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04320  conserved hypothetical protein  35.66 
 
 		 668 aa  240  4e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.931414  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  35.99 
 
 		 536 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.81 
 
 		 525 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0382  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.000000868135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2761  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  37.91 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2239  FAD dependent oxidoreductase  36.91 
 
 		 546 aa  238  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0659803 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0390  FAD dependent oxidoreductase  38.96 
 
 		 532 aa  237  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2214  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 534 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0610  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 540 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0615442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0329  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 528 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000174141  hitchhiker  0.00162584 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2521  FAD dependent oxidoreductase  35.38 
 
 		 519 aa  234  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2687  FAD dependent oxidoreductase  36.57 
 
 		 518 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.95747  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0484  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 533 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000858537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1243  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 		 520 aa  227  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1921  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 		 524 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 519 aa  226  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 582 aa  209  8e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 573 aa  208  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 		 574 aa  206  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35 
 
 		 605 aa  205  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.27 
 
 		 585 aa  205  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.33 
 
 		 591 aa  203  7e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 603 aa  203  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 579 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 572 aa  201  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 569 aa  199  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0248  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, anaerobic  30.02 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 600 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 583 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 577 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  33.13 
 
 		 579 aa  193  7e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 584 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.57 
 
 		 567 aa  191  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 582 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 567 aa  189  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 603 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 		 639 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 543 aa  187  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  33.47 
 
 		 574 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.47 
 
 		 587 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  33.54 
 
 		 576 aa  186  8e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  31.73 
 
 		 579 aa  186  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  34.78 
 
 		 595 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  32.45 
 
 		 568 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.81 
 
 		 554 aa  184  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2081  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 559 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 581 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1014  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5746  FAD dependent oxidoreductase  37.42 
 
 		 583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0411962  normal  0.0261037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 582 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0029  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 		 555 aa  180  7e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.65 
 
 		 514 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 579 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.34 
 
 		 512 aa  177  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  33.2 
 
 		 527 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1120  FAD dependent oxidoreductase  32.8 
 
 		 560 aa  177  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.917369 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 582 aa  177  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.61 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 579 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.61 
 
 		 502 aa  176  8e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4577  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 559 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.61 
 
 		 502 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0027  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 582 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  31.52 
 
 		 585 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 593 aa  174  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 546 aa  173  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.8 
 
 		 557 aa  172  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.44 
 
 		 503 aa  172  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 554 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3314  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 		 356 aa  172  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.781376 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_1129  predicted protein  30.56 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3651  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.993987 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>