181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1066 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  186  9e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  92.86 
 
 		 98 aa  176  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  76.09 
 
 		 99 aa  139  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  64.77 
 
 		 102 aa  118  3e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  61.25 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  61.25 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  61.25 
 
 		 92 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  60 
 
 		 92 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  55.32 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  55.32 
 
 		 100 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  51.14 
 
 		 92 aa  90.1  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  51.25 
 
 		 98 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  50 
 
 		 96 aa  80.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  51.16 
 
 		 97 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  44.87 
 
 		 84 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  56.92 
 
 		 237 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  53.03 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  45.95 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  52.63 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  52.63 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  45.45 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  42.17 
 
 		 85 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  43.06 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  44.74 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  44.74 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  44.74 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  44.74 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  44.74 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  40.58 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  44.74 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  41.11 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  45.21 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  44.44 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  46.67 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  42.11 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 92 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  39.51 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  41.67 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  41.67 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  38.95 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  32.14 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  52.31 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  35.63 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  46.15 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  38.95 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  40.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 		 196 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  38.16 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 		 197 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  39.74 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  52  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  39.08 
 
 		 196 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  40.3 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3665  YGGT family protein  36.14 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.688821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  32.43 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 		 182 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  32.5 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  38.57 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  34.25 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0517  hypothetical protein  27.4 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0567252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  38.46 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.73 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  30.77 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000825612  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  31.17 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  33.33 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  0.0000000251444 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  35.11 
 
 		 187 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0018  protein of unknown function YGGT  27.66 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  31.51 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  32.1 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3030  protein of unknown function YGGT  30.56 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0595  protein of unknown function YGGT  36.25 
 
 		 86 aa  47.4  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102021  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  31.58 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  33.72 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  35.29 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  30.95 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>