More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3040 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3040  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 128 aa  263  5e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00420401  normal  0.0677639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2442  rhodanese domain-containing protein  55.74 
 
 		 127 aa  145  3e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0138247  unclonable  0.00000228725 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1612  rhodanese domain-containing protein  52.38 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0487868  hitchhiker  0.00165935 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3105  phage shock protein E  56.03 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2613  rhodanese domain-containing protein  58.33 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.492032  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2691  rhodanese domain-containing protein  52.07 
 
 		 125 aa  134  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1391  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000425573  hitchhiker  0.000000000236853 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1456  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 132 aa  133  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00260172  hitchhiker  0.000336538 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1444  rhodanese domain-containing protein  58.59 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000545636  hitchhiker  0.00000000189127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1581  Rhodanese domain protein  60.2 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0432262  hitchhiker  0.00000000099869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2872  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2797  rhodanese domain-containing protein  57.14 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100597  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2777  rhodanese domain-containing protein  58.16 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000237337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2184  phage shock protein E  47.58 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0017776  hitchhiker  0.00888717 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1410  rhodanese-like protein  56.52 
 
 		 136 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000874287  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2476  rhodanese domain-containing protein  45.54 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0039  phage shock protein E  51.04 
 
 		 123 aa  107  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  45.38 
 
 		 116 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  47.12 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  46.46 
 
 		 116 aa  90.1  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2742  Rhodanese domain protein  51.25 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2837  Rhodanese domain protein  51.9 
 
 		 130 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0114953  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2652  rhodanese-like protein  51.35 
 
 		 130 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  39.05 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2592  rhodanese domain-containing protein  48.1 
 
 		 119 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.261053  normal  0.428361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1917  MerR family transcriptional regulator  51.43 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000461383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3904  rhodanese domain-containing protein  38.53 
 
 		 108 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000089939  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3701  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000331812  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0318  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000262088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0323  rhodanese domain-containing protein  39.58 
 
 		 107 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3528  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000546152  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4394  phage shock protein E  38.54 
 
 		 108 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0322  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0326  rhodanese domain-containing protein  39.62 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000194442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0308  rhodanese domain-containing protein  40 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000185007  hitchhiker  0.0000000893128 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0320  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 107 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000759321  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3397  phage shock protein E  38.54 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0327  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000770666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0262  Rhodanese domain protein  45.68 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  34.69 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1570  rhodanese-like domain-containing protein  42.35 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1561  rhodanese domain-containing protein  42.17 
 
 		 188 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.229111 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  34.55 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  42.05 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2943  rhodanese domain-containing protein  46.48 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.22665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  35.63 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  46.97 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2832  rhodanese domain-containing protein  41.67 
 
 		 109 aa  66.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0018114 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0529  rhodanese-like domain protein  43.18 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00586876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  42.11 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0687  Rhodanese domain protein  43.18 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000111268  hitchhiker  0.0000834379 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  46.27 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  42.25 
 
 		 98 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01624  putative phage shock protein E  36.46 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2629  Rhodanese domain protein  39.58 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.770931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1810  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000312161 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1950  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0207  Rhodanese domain protein  44.16 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000460889  normal  0.712093 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0533  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 		 568 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.913571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1646  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604972 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1464  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.176791  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1872  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0100112 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1811  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.197401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01285  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2338  phage shock operon rhodanese PspE  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00488281  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01296  hypothetical protein  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1814  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.309116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1423  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2317  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00657888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1518  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1544  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase  37.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  45.83 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  32.76 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  32.76 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  41.89 
 
 		 565 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  29.63 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  42.25 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  45.59 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  45.59 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.36 
 
 		 189 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  39.73 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  45.59 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  41.1 
 
 		 186 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  39.24 
 
 		 229 aa  60.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.23 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0916  rhodanese-like protein  40.79 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0001684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1505  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 		 581 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2684  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245912  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4697  Rhodanese domain protein  41.03 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0900105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1901  Rhodanese-related sulfurtransferase-like protein  35.16 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  38.36 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0149  rhodanese domain-containing protein  34.07 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0127705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  39.73 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0183  transcriptional regulator, ArsR family  38.1 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  42.11 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  39.29 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>