248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2675 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2675  Na+ dependent nucleoside transporter  100 
 
 		 401 aa  781    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0963  Na+ dependent nucleoside transporter  84.33 
 
 		 402 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0998  Na+ dependent nucleoside transporter  84.58 
 
 		 402 aa  675    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0983  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  84.33 
 
 		 402 aa  674    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3380  Na+ dependent nucleoside transporter  84.08 
 
 		 402 aa  671    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1234  sodium-dependent nucleoside transport protein  77.31 
 
 		 401 aa  611  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.114582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01390  hypothetical protein  75.81 
 
 		 399 aa  595  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1541  NupC family protein  74.06 
 
 		 405 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0424261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004082  NupC family protein  72.7 
 
 		 371 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.117555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1587  sodium-dependent nucleoside transporter  56.44 
 
 		 406 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0436928  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2501  nucleoside transport protein (nucleoside permease NupC)  53.88 
 
 		 404 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0111  nucleoside transporter  54.11 
 
 		 420 aa  412  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0616  putative sodium-dependent nucleoside transporter protein  52.36 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.552208  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000803  nucleoside permease NupC  52.25 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000113486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3706  NupC family protein  49.05 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1000  nucleoside transporter  51.33 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000184803  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1973  NupC family nucleoside transporter  52.57 
 
 		 414 aa  389  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.826575  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0093  NupC family protein  47.01 
 
 		 406 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1487  putative NupC family protein (permease)  50.99 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0659  nucleoside transporter  52.38 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.987509 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0289  transport system permease  51.77 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2817  nucleoside transporter  50.84 
 
 		 419 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000683947  hitchhiker  0.0000493259 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1098  NupC family protein  51.87 
 
 		 402 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3050  nucleoside transporter  50.96 
 
 		 419 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000162905  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1023  nucleoside transporter  50.12 
 
 		 420 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000239256  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_3189  nucleoside transporter  50.75 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.549787 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3851  nucleoside transporter  48.21 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002628  nucleoside permease NupC  51.55 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000361858  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2763  nucleoside transporter  50.5 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0532  nucleoside transporter  50.74 
 
 		 402 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03378  hypothetical protein  51.07 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2861  nucleoside transporter  50.86 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00729  putative Na+ dependent nucleoside transporter  50.25 
 
 		 403 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.103666  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1503  nucleoside transporter  51.96 
 
 		 414 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.570754  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3551  nucleoside transporter  49.76 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000301741  unclonable  0.0000000473709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3380  nucleoside transporter  49.52 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000393425  hitchhiker  0.00583621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4915  nucleoside transporter  48.21 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.105963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0634  Na+ dependent nucleoside transporter  50 
 
 		 408 aa  370  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1035  nucleoside transporter  50.12 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000565727  hitchhiker  0.000000000517288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1100  nucleoside transporter  51.08 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000101153  unclonable  0.0000254337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1039  Na+ dependent nucleoside transporter  50.12 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000852943  unclonable  0.000000000104739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0971  nucleoside transporter  50.36 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000546598  decreased coverage  0.000216747 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2824  nucleoside transporter  50.6 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000097854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0556  nucleoside transporter  53.81 
 
 		 425 aa  366  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1138  nucleoside transporter  52.07 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000131174  unclonable  0.00000000000578399 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1931  NupC family protein  49.51 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124283  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3232  nucleoside transporter  50.6 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3368  nucleoside transporter  50.6 
 
 		 419 aa  362  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000590778  hitchhiker  0.00789316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1717  nucleoside transporter  47.82 
 
 		 420 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0832  NupC family nucleoside transporter  52.36 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3499  NupC family nucleoside transporter  52.36 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3628  nucleoside transporter  52.36 
 
 		 423 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0458  nucleoside transporter  53.33 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3546  nucleoside transporter  51.15 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3229  nucleoside transporter  50.6 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000798644  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1214  NupC family protein  47.44 
 
 		 432 aa  356  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3295  Na+ dependent nucleoside transporter-like  47.6 
 
 		 418 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0945024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2908  Na+ dependent nucleoside transporter  46.08 
 
 		 419 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5354  NupC family nucleoside transporter  44.64 
 
 		 403 aa  346  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000134447  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5028  nucleoside transporter  45.04 
 
 		 403 aa  345  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000645183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5407  nucleoside transporter, NupC family  45.15 
 
 		 403 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000223055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3885  Na+ dependent nucleoside transporter  48.88 
 
 		 408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0740  concentrative nucleoside/H+ symporter  44.36 
 
 		 425 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0887086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4420  nucleoside transporter  44.12 
 
 		 425 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3093  Na+ dependent nucleoside transporter-like protein  45.48 
 
 		 417 aa  335  9e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.687878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3769  nucleoside transporter  44.13 
 
 		 403 aa  333  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000231054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0409  nucleoside transporter  43.33 
 
 		 426 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0109  nucleoside transporter  43.57 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1270  nucleoside transporter  43.57 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1069  nucleoside transporter  43.57 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0129  nucleoside transporter  43.57 
 
 		 424 aa  328  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6659  Na+ dependent nucleoside transporter  42.38 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0207815  normal  0.0527742 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2812  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  43.33 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2667  Na+ dependent nucleoside transporter family protein  43.33 
 
 		 566 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0472301  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2247  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.39 
 
 		 416 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00577659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1971  Na+ dependent nucleoside transporter  44.89 
 
 		 416 aa  319  5e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1926  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  45.82 
 
 		 416 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.146383 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2819  NupC family nucleoside transporter  42.64 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2505  NupC family protein  42.64 
 
 		 408 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.542894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5325  nucleoside transporter, NupC family  44.13 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.42869e-44 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4296  NupC family protein  45.77 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5085  NupC family nucleoside transporter  44.13 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4916  Na+ dependent nucleoside transporter  44.13 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.08996e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4931  Na+ dependent nucleoside transporter  44.13 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000051013  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5475  NupC family nucleoside transporter  44.13 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000807855  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5359  nucleoside transporter, NupC family  44.13 
 
 		 403 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000539018  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3487  Na+ dependent nucleoside transporter  46.25 
 
 		 401 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5601  nucleoside transporter, NupC family  44.13 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740053  hitchhiker  6.13455e-18 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1592  Na+ dependent nucleoside transporter-like  41.94 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6239  Na+ dependent nucleoside transporter  41.94 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.255767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6715  Na+ dependent nucleoside transporter  41.94 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5453  Na+ dependent nucleoside transporter  44.59 
 
 		 415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0296  Na+ dependent nucleoside transporter domain protein  42.3 
 
 		 413 aa  301  1e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0763703  normal  0.616931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1497  nucleoside transporter  43 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3297  nucleoside transporter, NupC family  42.75 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0458092  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2461  NupC family nucleoside transporter  43.6 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.766388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2308  NupC family nucleoside transporter  43 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.903484  hitchhiker  0.000933793 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2297  NupC family nucleoside transporter  42.75 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2458  NupC family nucleoside transporter  42.75 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5298  Na+ dependent nucleoside transporter  41.49 
 
 		 399 aa  295  8e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>