130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1111 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1111  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  474  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0309164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3025  hypothetical protein  71.67 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00392442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3109  hypothetical protein  71.25 
 
 		 240 aa  347  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.052504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1081  hypothetical protein  70 
 
 		 240 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000020952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3206  hypothetical protein  69.58 
 
 		 240 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1149  hypothetical protein  68.75 
 
 		 240 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0395177  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2930  hypothetical protein  70 
 
 		 240 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3012  hypothetical protein  70 
 
 		 240 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0896353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1183  hypothetical protein  69.17 
 
 		 240 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1089  hypothetical protein  68.75 
 
 		 240 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0210765  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3502  hypothetical protein  68.07 
 
 		 280 aa  338  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2652  hypothetical protein  68.03 
 
 		 242 aa  314  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000484219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1041  hypothetical protein  65.43 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  0.584816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0963  hypothetical protein  61.32 
 
 		 239 aa  290  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.151638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0933  hypothetical protein  58.7 
 
 		 244 aa  275  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.281157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2028  hypothetical protein  40.59 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2041  hypothetical protein  41.7 
 
 		 231 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0564933  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4680  hypothetical protein  43.26 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.467996  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0546  hypothetical protein  38.05 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0429  hypothetical protein  35.43 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0506  hypothetical protein  39.01 
 
 		 230 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255853  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0547  hypothetical protein  38.18 
 
 		 230 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0547  hypothetical protein  37.61 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3483  hypothetical protein  37.61 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3762  hypothetical protein  38.05 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.852713 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3818  hypothetical protein  38.05 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3944  hypothetical protein  38.05 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3533  hypothetical protein  36.89 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0599  hypothetical protein  35.29 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4354  hypothetical protein  37.62 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3326  hypothetical protein  39.22 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46580  hypothetical protein  35.17 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3732  hypothetical protein  32.39 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.817538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3159  hypothetical protein  33.8 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02514  hypothetical protein  33.63 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3155  hypothetical protein  32.56 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.751817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3079  hypothetical protein  34.31 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00504  hypothetical protein  31.72 
 
 		 273 aa  95.5  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4008  hypothetical protein  33.87 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.161963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1336  hypothetical protein  33.06 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1194  hypothetical protein  34.38 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0143956  hitchhiker  0.0000261256 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0595  putative transmembrane protein  33.03 
 
 		 234 aa  92.8  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.812754  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0239  hypothetical protein  33.62 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3711  hypothetical protein  34.12 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.167645  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1890  hypothetical protein  36.25 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1944  hypothetical protein  32.31 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0137324  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3265  putative transmembrane protein  30.84 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3587  hypothetical protein  30.84 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00011907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0052  hypothetical protein  29.15 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0060351  normal  0.567667 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0660  hypothetical protein  30.49 
 
 		 241 aa  85.9  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2231  hypothetical protein  39.83 
 
 		 280 aa  85.5  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2602  hypothetical protein  34.67 
 
 		 255 aa  85.1  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245239  normal  0.167948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3039  hypothetical protein  33.5 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1117  hypothetical protein  31.76 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3575  hypothetical protein  32.26 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.580348  hitchhiker  0.00969465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0717  hypothetical protein  35.5 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000102421  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0194  hypothetical protein  39.5 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.743567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1482  hypothetical protein  31.51 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1353  hypothetical protein  48.98 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1084  hypothetical protein  30.73 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0585166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1847  hypothetical protein  31.28 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.562939  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1005  hypothetical protein  37.14 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3033  hypothetical protein  47.96 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1317  hypothetical protein  47.96 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1829  hypothetical protein  27.12 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2512  hypothetical protein  38.26 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0104508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1327  hypothetical protein  47.96 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0478  hypothetical protein  34.25 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2615  hypothetical protein  29.6 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.360147  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0294  hypothetical protein  32.56 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.385476  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0274  hypothetical protein  44.66 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02644  putative periplasmic protein  32.95 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0197  hypothetical protein  29 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.680563 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3379  putative transmembrane protein  26.8 
 
 		 269 aa  74.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0216  signal peptide protein  29.61 
 
 		 271 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000480093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1989  hypothetical protein  25.1 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0926044  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3552  hypothetical protein  28.69 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0162  hypothetical protein  33.02 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.844011 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0805  hypothetical protein  30.15 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0153835 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0239  hypothetical protein  29.85 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0341  signal peptide protein  29.07 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0290  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5833  hypothetical protein  32.09 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0182  hypothetical protein  28.04 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.56754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2962  hypothetical protein  33.17 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0030  hypothetical protein  23.87 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00621032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1958  putative signal peptide protein  25.6 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0180  hypothetical protein  33.66 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.223462  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3838  hypothetical protein  25.96 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3931  hypothetical protein  25.96 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1750  hypothetical protein  30.24 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.034244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0546  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0802876  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4694  hypothetical protein  25.96 
 
 		 245 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4047  hypothetical protein  25.53 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4265  hypothetical protein  30.84 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4252  hypothetical protein  25 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2358  hypothetical protein  27.83 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0130  hypothetical protein  24.06 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0341016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50070  hypothetical protein  30.11 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0106693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0232  hypothetical protein  32.56 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>