289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2467 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  318  2e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  45.91 
 
 
159 aa  144  7e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.81248e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  41.51 
 
 
159 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.53536e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  40.88 
 
 
159 aa  141  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.25 
 
 
159 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  138  4e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  2.24859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  136  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  40.65 
 
 
177 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  133  8e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  38.99 
 
 
159 aa  133  1e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  43.87 
 
 
160 aa  132  1e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 
159 aa  133  1e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  2e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  2e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  40.25 
 
 
159 aa  132  2e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  2e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  2e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  2e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  2e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  132  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  132  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  2.87275e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 
159 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
159 aa  131  4e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  130  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 
167 aa  130  7e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  39.35 
 
 
167 aa  130  7e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
159 aa  127  7e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  43.21 
 
 
160 aa  127  9e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  126  1e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  125  2e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  7.42092e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
159 aa  124  4e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
160 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.73176e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  36.48 
 
 
160 aa  120  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  40.25 
 
 
159 aa  120  1e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  118  4e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  7.43067e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
159 aa  118  4e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.7339e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  35.4 
 
 
160 aa  117  8e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
159 aa  116  1e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1306  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 
152 aa  116  1e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.820189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  37.74 
 
 
159 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  34.59 
 
 
159 aa  114  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  40.38 
 
 
154 aa  111  4e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  34.59 
 
 
165 aa  111  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  35.4 
 
 
156 aa  110  7e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.14035e-07 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3859  protein of unknown function DUF163  37.97 
 
 
154 aa  110  1e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.161132 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
159 aa  110  1e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4128  hypothetical protein  37.97 
 
 
153 aa  108  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.67091e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  36.42 
 
 
150 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  7.74135e-12 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  37.74 
 
 
145 aa  107  6e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3775  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 
154 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.55884e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  38.61 
 
 
154 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  37.11 
 
 
158 aa  105  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  32.08 
 
 
159 aa  105  3e-22  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2414  hypothetical protein  34.59 
 
 
156 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  1.42803e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  38.61 
 
 
145 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  38.61 
 
 
144 aa  105  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0171  rRNA large subunit methyltransferase  40.62 
 
 
156 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  35.44 
 
 
156 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.09351e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  35.85 
 
 
153 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  39.24 
 
 
144 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  38.89 
 
 
153 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  34.59 
 
 
155 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  8.61677e-08 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
156 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  38.12 
 
 
153 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.89 
 
 
153 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  37.11 
 
 
155 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
155 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
156 aa  101  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.78909e-07  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2587  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
156 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.27435e-06  normal  0.158924 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3484  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  101  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  3.36055e-08  unclonable  3.93257e-11 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  38.22 
 
 
150 aa  100  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
156 aa  100  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  36.25 
 
 
157 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.16859e-08  decreased coverage  2.22893e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1093  rRNA large subunit methyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01218  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
156 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01881  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  99  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0790169  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1057  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  99  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.90967e-05  hitchhiker  0.00601071 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3148  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  99.4  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.32782e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0996  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.70066e-09  normal  0.150944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0992  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.54968e-07  normal  0.0933085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1169  rRNA large subunit methyltransferase  34.59 
 
 
156 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3274  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.53128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3452  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.35521e-05  hitchhiker  0.00271543 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  32.7 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  39.6 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.21376e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0083  hypothetical protein  37.97 
 
 
151 aa  98.2  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0170502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2139  hypothetical protein  35.85 
 
 
154 aa  98.2  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.895316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>