154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0210 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  100 
 
 
349 aa  724    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  70.77 
 
 
351 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  66.48 
 
 
349 aa  488  1e-137  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  71.18 
 
 
347 aa  488  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  65.04 
 
 
350 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  65.42 
 
 
349 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  67.62 
 
 
350 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  66.48 
 
 
350 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.89 
 
 
349 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  63.31 
 
 
348 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  60.98 
 
 
351 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.03 
 
 
349 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.59 
 
 
358 aa  412  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.33 
 
 
355 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  55.87 
 
 
349 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  54.65 
 
 
348 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  54.87 
 
 
354 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  52.45 
 
 
350 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  54.68 
 
 
352 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  55.12 
 
 
350 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.85 
 
 
346 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.56 
 
 
343 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  51.29 
 
 
349 aa  370  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  53.29 
 
 
349 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  55.2 
 
 
361 aa  368  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  53.16 
 
 
364 aa  364  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  51.3 
 
 
350 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  51.3 
 
 
350 aa  353  2e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  48.97 
 
 
350 aa  348  7e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  48.67 
 
 
358 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  50.29 
 
 
350 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  48.19 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  47.73 
 
 
347 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  49.4 
 
 
338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.08 
 
 
350 aa  323  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  49.09 
 
 
345 aa  321  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  48.24 
 
 
359 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  48.66 
 
 
340 aa  306  3e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  45.48 
 
 
337 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  47.26 
 
 
342 aa  292  5e-78  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  44.68 
 
 
344 aa  291  1e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.77 
 
 
343 aa  278  1e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.77 
 
 
343 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  43.77 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  39.1 
 
 
337 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.06 
 
 
342 aa  248  1e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  38.44 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  35.84 
 
 
349 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.44 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  37.61 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  36.78 
 
 
350 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.24 
 
 
358 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  35.31 
 
 
334 aa  202  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  36.25 
 
 
330 aa  202  8e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35 
 
 
338 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  36.75 
 
 
338 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  36.39 
 
 
340 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  35.56 
 
 
331 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.36 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  34.58 
 
 
334 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  35.8 
 
 
340 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.65 
 
 
335 aa  193  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  33.33 
 
 
333 aa  192  6e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  34.19 
 
 
351 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08721  ialic acid synthase  34.46 
 
 
342 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.938537  hitchhiker  0.00000164183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.87 
 
 
354 aa  189  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  34.92 
 
 
359 aa  189  8e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  34.23 
 
 
337 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0662  N-acetylneuraminate synthase  49.71 
 
 
194 aa  183  3e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.116223  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4942  N-acetylneuraminate synthase  33.53 
 
 
748 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  33.73 
 
 
332 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1845  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.14 
 
 
344 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.76 
 
 
344 aa  182  7e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1832  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.24 
 
 
394 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  32.81 
 
 
333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  34.78 
 
 
363 aa  180  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  40.43 
 
 
289 aa  180  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  38.11 
 
 
672 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4334  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.82 
 
 
356 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  36.52 
 
 
303 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.24 
 
 
349 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.37 
 
 
338 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0346  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.35 
 
 
313 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.417711 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.11 
 
 
351 aa  176  4e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  34.27 
 
 
357 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1274  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.67 
 
 
314 aa  176  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.12 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1158  sialic acid synthase  32.48 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00143382  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  36.64 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  33.71 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  33.71 
 
 
357 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0910  N-acetylneuraminate synthase  38.54 
 
 
289 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  36.16 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.71 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1072  sialic acid synthase  38.04 
 
 
293 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  32.58 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.94 
 
 
350 aa  172  6.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.43 
 
 
332 aa  171  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  31.74 
 
 
333 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  32.25 
 
 
749 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>