204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4408 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4408  CHAD domain-containing protein  100 
 
 		 490 aa  958    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.38693  normal  0.881049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1728  CHAD domain-containing protein  42.97 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101494  normal  0.255702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3074  CHAD domain-containing protein  41.22 
 
 		 505 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0601253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2906  CHAD domain-containing protein  42 
 
 		 511 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0809303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4215  CHAD domain containing protein  44.89 
 
 		 511 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3398  CHAD domain containing protein  40.73 
 
 		 512 aa  279  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.517581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3275  CHAD domain containing protein  40.92 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3081  CHAD domain-containing protein  40.54 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5441  CHAD domain containing protein  40 
 
 		 513 aa  276  7e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4991  CHAD domain-containing protein  37.37 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.913323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4466  CHAD domain-containing protein  37.17 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0383  adenylate cyclase  34.17 
 
 		 519 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1232  CHAD domain-containing protein  35.9 
 
 		 508 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4624  adenylate cyclase  36.71 
 
 		 510 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.283729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2370  adenylate cyclase  34.36 
 
 		 514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1706  CHAD domain-containing protein  34.31 
 
 		 510 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201862  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3355  adenylate cyclase  32.98 
 
 		 487 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.658253  normal  0.866981 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2069  adenylate cyclase  32.98 
 
 		 494 aa  186  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2024  adenylate cyclase  31.44 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374055  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0089  adenylate cyclase  32.41 
 
 		 505 aa  169  9e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3533  CHAD domain containing protein  34.12 
 
 		 520 aa  168  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0421561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5361  hypothetical protein  32.06 
 
 		 596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319316  hitchhiker  0.00226049 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1086  adenylate cyclase  34.15 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2354  adenylate cyclase  33.33 
 
 		 543 aa  154  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.87441  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1029  CHAD  30.68 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.739933  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2918  adenylate cyclase  35.7 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1159  adenylate cyclase  35.91 
 
 		 512 aa  136  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964289  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2018  hypothetical protein  30.95 
 
 		 505 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000169644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3610  adenylate cyclase  34.18 
 
 		 498 aa  133  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0101894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4651  CHAD  35.95 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2680  hypothetical protein  31.99 
 
 		 505 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0254729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1216  CHAD domain containing protein  35.16 
 
 		 509 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0370  CHAD domain containing protein  31.73 
 
 		 512 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0297118  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0379  adenylate cyclase  32.13 
 
 		 512 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3095  adenylate cyclase  33.54 
 
 		 508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.004296  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1449  adenylate cyclase  30.04 
 
 		 519 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00311247  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004527  adenylate cyclase  29.42 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0908  adenylate cyclase  37.13 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00951496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0884  adenylate cyclase  37.13 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0453465  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00864  hypothetical protein  30.05 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3392  adenylate cyclase  30 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3456  adenylate cyclase  30 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.333438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3388  adenylate cyclase  29.75 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3454  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 508 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.320835  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3462  adenylate cyclase  30 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3558  adenylate cyclase  29.75 
 
 		 433 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.574554  normal  0.228439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0918  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 508 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.57743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4015  CHAD  35.35 
 
 		 327 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0520  CHAD domain-containing protein  31.6 
 
 		 318 aa  103  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348469 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0182  adenylate cyclase  26.18 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3769  hypothetical protein  35.64 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0710  adenylate cyclase  40 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0564  adenylate cyclase  29.47 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0823  adenylate cyclase  35.07 
 
 		 503 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000128674  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3851  adenylate cyclase  32.07 
 
 		 495 aa  98.2  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0188416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1230  CHAD  33.07 
 
 		 328 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1415  CHAD domain containing protein  34.38 
 
 		 310 aa  97.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3517  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0854  adenylate cyclase  34.6 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0014497  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2332  adenylate cyclase  34.04 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.440295 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3842  adenylate cyclase  31.27 
 
 		 500 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.023324  hitchhiker  0.0000000503049 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2672  hypothetical protein  34.26 
 
 		 492 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2393  adenylate cyclase  29.25 
 
 		 321 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5247  CHAD domain containing protein  29.96 
 
 		 539 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0011816  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2542  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 328 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4365  adenylate cyclase  33.82 
 
 		 433 aa  94  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3118  adenylate cyclase  33.65 
 
 		 503 aa  93.6  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000370721  normal  0.76725 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3346  adenylate cyclase  36.63 
 
 		 433 aa  93.2  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.748086  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02924  predicted adenylate cyclase  37.62 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0646  adenylate cyclase  37.62 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201225  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02874  hypothetical protein  37.62 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00301101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0645  adenylate cyclase  37.62 
 
 		 433 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000445512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1549  adenylate cyclase  29.96 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1874  adenylate cyclase  29.96 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0718  adenylate cyclase  32.52 
 
 		 500 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00048972  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3485  adenylate cyclase  37.62 
 
 		 433 aa  90.9  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.832353  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4676  CHAD domain-containing protein  27.27 
 
 		 521 aa  90.1  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3231  adenylate cyclase  37.13 
 
 		 433 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0693  adenylate cyclase  31.9 
 
 		 321 aa  89.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000106533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0619  adenylate cyclase  34.68 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3486  adenylate cyclase  31.34 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00832211  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5853  CHAD domain-containing protein  32.8 
 
 		 304 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0774  adenylate cyclase  34.15 
 
 		 286 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.146589  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1628  adenylate cyclase  24.95 
 
 		 518 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0327322 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0350  adenylate cyclase  36.97 
 
 		 454 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03713  hypothetical protein  26.4 
 
 		 501 aa  85.5  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.153655  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3753  CHAD domain-containing protein  33.09 
 
 		 545 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0606624  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1105  adenylate cyclase  34.76 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807346 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4030  adenylate cyclase  30.83 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal  0.848067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2240  hypothetical protein  32.21 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388938  normal  0.10608 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3224  CHAD domain-containing protein  32.37 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.870924  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4196  putative adenylate cyclase  28.52 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5954  hypothetical protein  35.56 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0589  CHAD domain-contain protein  33.96 
 
 		 577 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1473  CHAD domain-containing protein  33.73 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.57083  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1670  hypothetical protein  33.73 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0325  CHAD domain-containing protein  33.73 
 
 		 640 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0293  hypothetical protein  33.73 
 
 		 688 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1914  CHAD  27.99 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0216561  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4291  adenylate cyclase  30.8 
 
 		 435 aa  77  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.051247  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>