81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_16080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 323 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  56.21 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  54.68 
 
 		 304 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  47.27 
 
 		 342 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  48.2 
 
 		 318 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  47.27 
 
 		 342 aa  216  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  44.22 
 
 		 337 aa  215  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  46.91 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  48.52 
 
 		 318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  42.77 
 
 		 328 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  41.77 
 
 		 329 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  41.33 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  44.29 
 
 		 351 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  42.35 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  41.21 
 
 		 351 aa  168  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  43.64 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  39.68 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  39.67 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  38.28 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  38.44 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  40.07 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  40.19 
 
 		 325 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  41.57 
 
 		 313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  38.22 
 
 		 320 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  41.05 
 
 		 342 aa  149  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  39.39 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  40 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  38.63 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.17 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  36.66 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  40.59 
 
 		 309 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  39.26 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  39.08 
 
 		 370 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  37.95 
 
 		 314 aa  139  7e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  36.92 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.6 
 
 		 287 aa  133  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  35.52 
 
 		 331 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  34.17 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  46.08 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  28.86 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  31.78 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  27.64 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  30.21 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  29.41 
 
 		 622 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  24.33 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  22.97 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  22.15 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  27.22 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2601  putative cytochrome aa3 controlling protein  31.91 
 
 		 304 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.705731 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  25.53 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  29.57 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  21.51 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  26.5 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06105  cytochrome oxidase assembly protein  51.52 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  30.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  30.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  30.43 
 
 		 311 aa  46.6  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 		 354 aa  46.2  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3528  cytochrome oxidase assembly  29.95 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  28.18 
 
 		 317 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  21.17 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  21.63 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1387  cytochrome oxidase assembly  29.67 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  30.32 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  32 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  32 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  27.34 
 
 		 325 aa  43.9  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0126  cytochrome oxidase assembly  30.43 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  39.73 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0109  cytochrome oxidase assembly  29.93 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.475032  normal  0.476439 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2851  cytochrome oxidase assembly  30.77 
 
 		 399 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.413264  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  28.69 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  37.3 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  30.4 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  27.75 
 
 		 452 aa  42.4  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>