More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_15820 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  100 
 
 		 343 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  58.44 
 
 		 334 aa  351  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.92 
 
 		 326 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  58.41 
 
 		 330 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  56.69 
 
 		 321 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  56 
 
 		 335 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  60.06 
 
 		 318 aa  309  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.09 
 
 		 342 aa  298  7e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  58.86 
 
 		 320 aa  292  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  54.55 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  56.7 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  48.55 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.72 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  46.2 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.28 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.65 
 
 		 319 aa  243  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.7 
 
 		 299 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.14 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  40.06 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  47.44 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  50.4 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.47 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.47 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.47 
 
 		 334 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.63 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  44.55 
 
 		 302 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  30.42 
 
 		 510 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  39.29 
 
 		 522 aa  88.6  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  25.79 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  25.79 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  30.1 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  31.61 
 
 		 209 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  33.33 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  30 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 206 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.36 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  35.94 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  28.81 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  35.16 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  29.59 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  29.13 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  28.68 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  33.89 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  26.24 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.7 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.7 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.7 
 
 		 407 aa  65.9  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0260  glycosyl transferase family 2  34.5 
 
 		 273 aa  65.9  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.306809  normal  0.712495 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.54 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  48.96 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  29.51 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  26.63 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.7 
 
 		 409 aa  62  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  31.67 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  37.5 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  26.27 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  35.1 
 
 		 752 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  32.97 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  38.54 
 
 		 305 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  28.19 
 
 		 694 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  37.76 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  28.44 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  25.98 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0824  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 234 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.216941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  33.55 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  36.63 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  31.65 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  29.11 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  37.3 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  22.46 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  39.22 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  25.87 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  26 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  28.91 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  28.36 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0034  family 2 glycosyl transferase  34.1 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  29 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>