161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01550 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01550  N-acetylneuraminate synthase  100 
 
 		 349 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0492033 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1204  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  71.22 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3208  pseudaminic acid synthase  57.88 
 
 		 351 aa  426  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0587  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  56.36 
 
 		 349 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.518416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3942  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  53.58 
 
 		 349 aa  391  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0693356 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3098  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.67 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.298576  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1523  N-acetylneuraminate synthase  58.45 
 
 		 350 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3008  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  59.6 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1724  pseudaminic acid synthase  52.15 
 
 		 349 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000954999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0210  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.87 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.803069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2097  neuB protein  53.22 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.268336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0774  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  55.46 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.453022  normal  0.512992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3707  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  58.45 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4303  N-acetylneuraminate synthase  58.38 
 
 		 361 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1772  N-acetylneuraminate synthase  53.78 
 
 		 350 aa  363  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4269  pseudaminic acid synthase  55.52 
 
 		 351 aa  362  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.948479 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3556  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  57.96 
 
 		 358 aa  360  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2327  N-acetylneuraminate synthase  55.02 
 
 		 350 aa  359  5e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.463819 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0647  antifreeze-like protein  52.8 
 
 		 350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.318568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2758  N-acetylneuraminate synthase  53.91 
 
 		 348 aa  353  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3027  pseudaminic acid synthase  51.04 
 
 		 349 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1329  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  52.2 
 
 		 358 aa  352  4e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1196  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.87 
 
 		 350 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1248  N-acetylneuraminate synthase  52.68 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.862744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3076  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.88 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1969  N-acetylneuraminate synthase  55.46 
 
 		 364 aa  342  8e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0891356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0660  N-acetylneuraminate synthase  46.42 
 
 		 349 aa  334  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.297547  normal  0.963703 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3113  N-acetylneuraminic acid synthase-like protein  51.03 
 
 		 359 aa  333  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1304  N-acetylneuraminate synthase  46.24 
 
 		 350 aa  332  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.583965  normal  0.823534 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2229  N-acetylneuraminate synthase  45.66 
 
 		 350 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2625  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.56 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3564  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  51.05 
 
 		 343 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02907  NeuB:Antifreeze-like protein  45.91 
 
 		 347 aa  311  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.269494  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13043  sialic acid synthase  46.39 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1289  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  45.43 
 
 		 350 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2425  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  47.29 
 
 		 345 aa  306  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.149839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2213  pseudaminic acid synthase  44.22 
 
 		 345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1391  N-acetylneuraminate synthase  46.83 
 
 		 337 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1556  sialic acid synthase  46.71 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0565  spore coat polysaccharide biosynthesis protein SpsE  46.04 
 
 		 342 aa  275  7e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0169  N-acetylneuraminic acid synthetase  40.06 
 
 		 344 aa  260  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0138828  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1512  N-acetylneuraminic acid synthetase  38.71 
 
 		 343 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1970  polysaccharide biosynthesis protein, putative  41.76 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.237085  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0397  N-acetylneuraminic acid synthetase  38.71 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.397069  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0756  N-acetylneuraminate synthase  39.82 
 
 		 337 aa  243  5e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1334  N-acetylneuraminic acid synthetase  39 
 
 		 343 aa  240  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0643  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  39.52 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0385  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.36 
 
 		 334 aa  218  8.999999999999998e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0420  N-acetylneuraminate synthase  33.33 
 
 		 349 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1516  N-acetylneuraminic acid synthetase  36.36 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.350916  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2641  N-acetylneuraminate synthase  36.91 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0818  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  36.31 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1235  flagellin modification protein PtmC, putative N-acetylneuraminic acid synthetase  33.75 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000147783  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1586  N-acetylneuraminate synthase  35.38 
 
 		 347 aa  209  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0789  N-acetylneuraminic acid condensing enzyme  36.61 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0506  N-acetylneuraminate synthase  33.43 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0527  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.65 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.783884  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16950  N-acetylneuraminate synthase  36.31 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3980  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.29 
 
 		 350 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2303  general stress protein 14 (GSP14)  34.26 
 
 		 333 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12451  sialic acid synthase  37.24 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0694401  hitchhiker  0.00593947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3405  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.1 
 
 		 358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0131  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.31 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000538819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  42.66 
 
 		 672 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0169  N-acetylneuraminic acid synthase  34.56 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.922982  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0254  N-acetylneuraminic acid synthase  34.56 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1576  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  40.47 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0010  n-acetylneuraminate synthase  40.82 
 
 		 303 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124512  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0412  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.35 
 
 		 338 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.336797 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001800  N-acetylneuraminate synthase  34.88 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0595  N-acetylneuraminate synthase  33.96 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4086  N-acetylneuraminate synthase  35.86 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0049  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  37.01 
 
 		 357 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0631  N-acetylneuraminate synthase  36.34 
 
 		 359 aa  189  9e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2977  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.35 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3121  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.35 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1456  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  38.11 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1582  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.93 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.807685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0367  N-acetylneuraminate synthase  37.24 
 
 		 360 aa  186  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1161  N-acetyl neuramic acid synthetase NeuB  33.96 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3256  N-acetylneuraminate synthase  37.32 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2369  N-acetylneuraminate synthase  36.69 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0796873  normal  0.0101527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3011  putative sialic acid synthase NeuB  33.54 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.62069  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3100  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.23 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0151  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  35.47 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0562  N-acetylneuraminate synthase  37.58 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3232  polysialic acid capsule biosynthesis sialic acid synthase NeuB  33.84 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00670  sialic acid synthase  33.43 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2221  N-acetylneuraminate synthase  35.38 
 
 		 761 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1458  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.54 
 
 		 334 aa  178  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1534  N-acetylneuraminate synthase  34.06 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1580  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.04 
 
 		 749 aa  176  6e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0797  N-acetylneuraminate synthase  40 
 
 		 289 aa  176  7e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0019  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.55 
 
 		 350 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3726  N-acetylneuraminic acid synthase domain  34.47 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14081  sialic acid synthase  32.44 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1664  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  30.06 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0843  N-acetylneuraminate synthase  38.41 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2331  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  33.74 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2590  N-acylneuraminate-9-phosphate synthase  34.58 
 
 		 338 aa  169  8e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139935 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>