More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0003 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  47.83 
 
 		 804 aa  706    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  47.83 
 
 		 804 aa  706    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  47.35 
 
 		 804 aa  686    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0003  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 851 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  51.32 
 
 		 795 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 		 806 aa  695    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0004  DNA gyrase, B subunit  46.79 
 
 		 795 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.904157 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0003  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0004  DNA gyrase, B subunit  48.4 
 
 		 805 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.195183  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3030  DNA gyrase, B subunit  47.76 
 
 		 804 aa  679    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  47.69 
 
 		 804 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3440  DNA gyrase subunit B  45.64 
 
 		 842 aa  641    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.683175  normal  0.447385 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0121  DNA gyrase subunit B  46.91 
 
 		 810 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.853058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0004  DNA gyrase, B subunit  46.22 
 
 		 814 aa  662    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0003  DNA gyrase subunit B  67.45 
 
 		 769 aa  1071    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0004  DNA gyrase, B subunit  48.27 
 
 		 805 aa  688    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.986187  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0125  DNA gyrase subunit B  47.04 
 
 		 810 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0011  DNA gyrase, B subunit  48.46 
 
 		 805 aa  693    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0004  DNA gyrase, subunit B  48.26 
 
 		 805 aa  697    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2886  DNA gyrase, B subunit  45.33 
 
 		 812 aa  658    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  50.75 
 
 		 794 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2054  DNA gyrase subunit B  67.32 
 
 		 770 aa  1062    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  46.06 
 
 		 811 aa  660    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0003  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0925325  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  49.19 
 
 		 805 aa  718    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0004  DNA gyrase, subunit B (type II topoisomerase)  49.32 
 
 		 805 aa  719    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0004  DNA gyrase subunit B  48.32 
 
 		 805 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  46.28 
 
 		 807 aa  692    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  48.64 
 
 		 804 aa  710    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0029  DNA gyrase subunit B  67.45 
 
 		 769 aa  1072    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.147794  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0417  DNA gyrase subunit B  46.36 
 
 		 798 aa  686    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0004  DNA gyrase subunit B  48.7 
 
 		 806 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  46.53 
 
 		 813 aa  658    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0299  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.281677  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0019  DNA gyrase, B subunit  48.77 
 
 		 807 aa  728    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  48.08 
 
 		 805 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  45.94 
 
 		 811 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  49.5 
 
 		 795 aa  726    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0004  DNA gyrase, B subunit  48.4 
 
 		 805 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0005  DNA gyrase, B subunit  48.11 
 
 		 798 aa  691    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2850  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60732  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1346  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 		 809 aa  679    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  51.82 
 
 		 795 aa  743    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0003  DNA gyrase subunit B  48.58 
 
 		 797 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.561355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  47.6 
 
 		 813 aa  706    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0008  DNA gyrase subunit B  45.89 
 
 		 812 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0003  DNA gyrase subunit B  100 
 
 		 769 aa  1583    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0003  DNA gyrase subunit B  45.52 
 
 		 810 aa  648    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.835475  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0003  DNA gyrase subunit B  67.45 
 
 		 769 aa  1073    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3241  DNA gyrase subunit B  45.11 
 
 		 822 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0004  DNA gyrase subunit B  46.67 
 
 		 795 aa  652    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  46.28 
 
 		 813 aa  661    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  45.94 
 
 		 811 aa  658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0003  DNA gyrase, B subunit  45.6 
 
 		 832 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0721  DNA gyrase, B subunit  45.04 
 
 		 783 aa  652    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0620  DNA gyrase, B subunit  46.65 
 
 		 798 aa  679    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0004  DNA gyrase subunit B  47.5 
 
 		 805 aa  658    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0005  DNA gyrase subunit B  49.38 
 
 		 810 aa  707    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.124529  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0004  DNA gyrase subunit B  48.64 
 
 		 808 aa  706    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00999238  normal  0.275353 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  45.34 
 
 		 813 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0003  DNA gyrase subunit B  46.41 
 
 		 798 aa  656    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0221229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0004  DNA gyrase subunit B  66.75 
 
 		 768 aa  1038    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0782517  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  47.04 
 
 		 807 aa  701    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0004  DNA gyrase, B subunit  49.38 
 
 		 805 aa  697    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.236407  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  47.2 
 
 		 811 aa  677    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  46.38 
 
 		 813 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0004  DNA gyrase subunit B  47.33 
 
 		 805 aa  697    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0004  DNA gyrase subunit B  45.58 
 
 		 813 aa  639    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0771659  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0006  DNA gyrase, B subunit  44.8 
 
 		 871 aa  681    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44586  hitchhiker  0.00403609 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  47.83 
 
 		 804 aa  706    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0131  DNA gyrase, B subunit  46.07 
 
 		 802 aa  665    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.155863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2235  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0007  DNA gyrase subunit B  46.6 
 
 		 805 aa  670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.197226  normal  0.376081 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0004  DNA gyrase, B subunit  47.96 
 
 		 805 aa  683    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279894  hitchhiker  0.0000731139 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0087  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0004  DNA gyrase subunit B  49.07 
 
 		 806 aa  704    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1873  DNA gyrase, B subunit  46.34 
 
 		 813 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3603  DNA gyrase subunit B  47.64 
 
 		 815 aa  681    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2504  DNA gyrase subunit B  49.75 
 
 		 805 aa  723    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.892795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1708  DNA gyrase subunit B  49.63 
 
 		 807 aa  719    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0004  DNA gyrase subunit B  49.14 
 
 		 805 aa  696    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.850847  unclonable  0.0000000000498396 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0004  DNA gyrase subunit B  49.14 
 
 		 805 aa  696    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.666874  normal  0.0301328 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  46.99 
 
 		 805 aa  710    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0004  DNA gyrase, B subunit  48.34 
 
 		 805 aa  694    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166192  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00445  DNA gyrase subunit B  48.39 
 
 		 805 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0014  DNA gyrase subunit B  47.1 
 
 		 800 aa  668    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0003  DNA gyrase subunit B  45.27 
 
 		 824 aa  643    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.147322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  48.82 
 
 		 806 aa  704    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  47.4 
 
 		 804 aa  706    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0101  DNA gyrase subunit B  44.99 
 
 		 822 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0139  DNA gyrase subunit B  46.3 
 
 		 807 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  47.39 
 
 		 806 aa  695    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  48.9 
 
 		 812 aa  722    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0012  DNA gyrase subunit B  49.01 
 
 		 805 aa  694    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000257607 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0003  DNA gyrase subunit B  66.97 
 
 		 773 aa  1046    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.380476  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  49.38 
 
 		 802 aa  712    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0007  DNA gyrase, B subunit  46.59 
 
 		 814 aa  671    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000127648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0416  DNA gyrase subunit B  45.51 
 
 		 812 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0016  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.64 
 
 		 805 aa  697    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.976365  hitchhiker  0.00112252 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3717  DNA gyrase, B subunit  47.19 
 
 		 809 aa  693    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468303  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>