292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2157 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  100 
 
 		 485 aa  992    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  63.79 
 
 		 485 aa  618  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  63.08 
 
 		 475 aa  607  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  62.53 
 
 		 495 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  61.33 
 
 		 490 aa  588  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  61.01 
 
 		 484 aa  587  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  61.12 
 
 		 490 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  61.34 
 
 		 484 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  61.44 
 
 		 484 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  60.92 
 
 		 484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  59.63 
 
 		 483 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  59.22 
 
 		 487 aa  568  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  60.59 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  62.08 
 
 		 485 aa  571  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  63.2 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  61.55 
 
 		 481 aa  567  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  55.75 
 
 		 527 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  57.98 
 
 		 485 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  61.04 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  60.33 
 
 		 488 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  60.81 
 
 		 486 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  58.56 
 
 		 495 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  61.43 
 
 		 498 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  61.68 
 
 		 483 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  60.17 
 
 		 486 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  54.8 
 
 		 500 aa  549  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  55.82 
 
 		 536 aa  547  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  56.27 
 
 		 541 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  58.93 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  58.02 
 
 		 484 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  56.08 
 
 		 541 aa  544  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  56.08 
 
 		 541 aa  543  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  56.74 
 
 		 560 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  56.37 
 
 		 556 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  56.37 
 
 		 565 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  56.37 
 
 		 526 aa  537  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  55.78 
 
 		 534 aa  535  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  55.67 
 
 		 510 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  59.02 
 
 		 523 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  57.93 
 
 		 501 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  58.93 
 
 		 504 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  59.05 
 
 		 486 aa  531  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  58.26 
 
 		 534 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  59.02 
 
 		 529 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  56.22 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  59.02 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  59.02 
 
 		 531 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  59.43 
 
 		 545 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  59.02 
 
 		 512 aa  531  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  58.81 
 
 		 585 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  58.61 
 
 		 520 aa  528  1e-149  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  55.38 
 
 		 534 aa  528  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  52.76 
 
 		 554 aa  525  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  60.29 
 
 		 500 aa  521  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  59.53 
 
 		 488 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  53.09 
 
 		 523 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  58.2 
 
 		 500 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  57.52 
 
 		 504 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  58.4 
 
 		 500 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  57.79 
 
 		 511 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  57.79 
 
 		 511 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  53.37 
 
 		 536 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  57.38 
 
 		 511 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  55.79 
 
 		 510 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.09 
 
 		 500 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  55.49 
 
 		 511 aa  499  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  54.18 
 
 		 502 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  47.71 
 
 		 483 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1872  cobyric acid synthase  46.88 
 
 		 483 aa  428  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  47.5 
 
 		 506 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  47.4 
 
 		 486 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  46.69 
 
 		 480 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0736  cobyric acid synthase  53.03 
 
 		 494 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.953548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  48.85 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  50.42 
 
 		 477 aa  415  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0789  cobyric acid synthase  53.21 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00846074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1765  cobyric acid synthase  50 
 
 		 484 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.504033  normal  0.0308945 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  46.84 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  46.2 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  45.38 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  49.37 
 
 		 492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  45.47 
 
 		 797 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  50.41 
 
 		 493 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.98 
 
 		 776 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.86 
 
 		 481 aa  404  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.65 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  45.24 
 
 		 787 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0634  cobyric acid synthase  50.73 
 
 		 495 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0946562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2571  cobyric acid synthase  48.42 
 
 		 484 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  48.44 
 
 		 500 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  44.87 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  44.62 
 
 		 532 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  41.07 
 
 		 507 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  45.88 
 
 		 488 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  44.05 
 
 		 777 aa  395  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2427  cobyric acid synthase CobQ  46.9 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  46.88 
 
 		 481 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  48.11 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2141  cobyric acid synthase CobQ  46.49 
 
 		 489 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  48.02 
 
 		 500 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>