275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9237 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9237  taurine dioxygenase  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  33.82 
 
 
301 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  31.65 
 
 
295 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  32 
 
 
300 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  32 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  32.37 
 
 
308 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  30.04 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  30.32 
 
 
302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  30.58 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  29.86 
 
 
299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  29.97 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  29.97 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  29.5 
 
 
299 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  29.14 
 
 
299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  29.5 
 
 
299 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  30.31 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  28.88 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  30.45 
 
 
308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  28.68 
 
 
298 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  29.02 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  29.02 
 
 
308 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  28.99 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  27.84 
 
 
305 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  27.96 
 
 
299 aa  119  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  26.62 
 
 
281 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  30.65 
 
 
273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  25.18 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  25.18 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0131  TauD/TfdA family dioxygenase  25.18 
 
 
327 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.442379  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  26.94 
 
 
287 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.62 
 
 
287 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.09 
 
 
284 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  28.62 
 
 
290 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6017  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.73 
 
 
301 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4891  taurine dioxygenase  27.44 
 
 
273 aa  102  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440182  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  26.79 
 
 
277 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  26.79 
 
 
335 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  28.86 
 
 
297 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  25.18 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  27.08 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  26.43 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  26.43 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  26.43 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  26.43 
 
 
277 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  26.43 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  26.43 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0955  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.82 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.3545  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.52 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  25.54 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6479  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.25 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  27.14 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.68 
 
 
278 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5054  taurine dioxygenase  29.37 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  26.26 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0297  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.99 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.849984  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02787  hypothetical protein  22.88 
 
 
314 aa  92.4  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  26.69 
 
 
277 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  24.82 
 
 
264 aa  92.4  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  27.74 
 
 
285 aa  92.4  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  26.33 
 
 
277 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  24.82 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
289 aa  89.7  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7176  taurine dioxygenase  28.12 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  24.82 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4633  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  28.42 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0817335  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  24.82 
 
 
282 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3714  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.64 
 
 
275 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.47 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  28.91 
 
 
285 aa  89.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1161  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  31.63 
 
 
281 aa  89  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00427132  normal  0.195503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1717  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  26.41 
 
 
282 aa  89  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3847  taurine dioxygenase  27.78 
 
 
282 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6916  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.09 
 
 
277 aa  89  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  24.91 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  25.98 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  25.44 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  25.71 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  28.89 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  25.71 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02180  sulfonate dioxygenase, putative  27.07 
 
 
388 aa  87  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450194  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2676  taurine dioxygenase  26.21 
 
 
282 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4841  taurine dioxygenase  26.92 
 
 
282 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0039228  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  26.98 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7105  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  25.82 
 
 
278 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10098  oxidoreductase  23.91 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  27.88 
 
 
307 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  24.29 
 
 
306 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  27.08 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2147  taurine dioxygenase  26.33 
 
 
282 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  25.8 
 
 
283 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  25.8 
 
 
292 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2819  taurine dioxygenase  26.21 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.373247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  24.48 
 
 
280 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13441  dioxygenase  25.74 
 
 
295 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.379206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>