118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2620 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  64.07 
 
 
307 aa  349  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  60.14 
 
 
324 aa  317  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  60.14 
 
 
324 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  53.85 
 
 
334 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  53 
 
 
303 aa  246  3e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  51.34 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  50.5 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  49.83 
 
 
291 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.62 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  45.95 
 
 
286 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  45.12 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  46.62 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  44.37 
 
 
285 aa  196  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  48.39 
 
 
290 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  43.38 
 
 
288 aa  190  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  43.1 
 
 
286 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  41.5 
 
 
283 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  45.64 
 
 
288 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  44.93 
 
 
285 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  41.61 
 
 
303 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  41.61 
 
 
303 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  42.18 
 
 
285 aa  183  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  41.61 
 
 
303 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  44.77 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  41.82 
 
 
287 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  42.21 
 
 
294 aa  179  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  43.39 
 
 
281 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  42.6 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  42.6 
 
 
276 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  42.6 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
272 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  40.64 
 
 
281 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  41.69 
 
 
285 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  43.23 
 
 
301 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  42.65 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  34.12 
 
 
275 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  32.87 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.97 
 
 
322 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  34.8 
 
 
327 aa  80.9  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  29.62 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  29.84 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.36 
 
 
346 aa  68.9  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  34.51 
 
 
346 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  28.96 
 
 
335 aa  56.6  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  32.87 
 
 
352 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  26.87 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  29.56 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  28.63 
 
 
353 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  25.75 
 
 
350 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.59 
 
 
333 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  25.9 
 
 
372 aa  53.9  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2006  putative N5,N10-methylenetetrahydromethanopterin reductase-related protein  28.57 
 
 
335 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0169524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  27.7 
 
 
321 aa  52.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  30.99 
 
 
318 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  30.99 
 
 
318 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  30.99 
 
 
318 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  29.38 
 
 
306 aa  52  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.39 
 
 
336 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  30.81 
 
 
359 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  27.53 
 
 
348 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  33.94 
 
 
330 aa  50.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  25.53 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.2 
 
 
332 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.76 
 
 
325 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.01 
 
 
339 aa  49.3  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  32.24 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  26.62 
 
 
344 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.06 
 
 
361 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  26.9 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2778  Luciferase-like monooxygenase  33.04 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  25.59 
 
 
339 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  35.76 
 
 
317 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1795  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1842  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  28.74 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1776  putative oxidoreductase  28.57 
 
 
353 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.4 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  28.82 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.4 
 
 
346 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  27.17 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  32 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  27.54 
 
 
346 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  27.94 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  27.01 
 
 
341 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4273  Luciferase-like monooxygenase  28.57 
 
 
309 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.268584  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  25.1 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.56 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  29.23 
 
 
345 aa  44.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0758  luciferase family protein  33.6 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.556053  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  42.68 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  25.5 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4157  hypothetical protein  25.85 
 
 
345 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>