54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1891 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1891  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000479557 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1671  LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1563  LuxR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 194 aa  164  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1707  LuxR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0182424  hitchhiker  0.000162083 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0336  two component LuxR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3050  LuxR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2542  response regulator receiver protein  18.52 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000537034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4606  transcriptional regulatory protein  26.7 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.35086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2145  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  18.95 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000312117  hitchhiker  0.00586911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2199  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  18.95 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283228  normal  0.62751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1259  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  18.95 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0272351  normal  0.751941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1137  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  18.95 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000192642  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2141  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  18.95 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000944438  normal  0.224442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4608  two component LuxR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2728  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  17.99 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000830515  normal  0.480733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1697  transcriptional regulator, LuxR family  17.99 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115016  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1233  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  17.99 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2184  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  17.99 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000916169  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0280  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.68 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2051  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  17.99 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.74459e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0250  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.23 
 
 		 260 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.664516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  35.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1691  LuxR family transcriptional regulator  17.99 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000265916  hitchhiker  0.00232643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  22.02 
 
 		 221 aa  45.1  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  34.78 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4290  LuxR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.397968 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1072  colanic acid capsular biosynthesis activation protein A  18.23 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000307954  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2014  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.43 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.172206  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3847  LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126392  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19740  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  32.69 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  38 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  40 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 351 aa  42.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.692808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  38 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0960  two component LuxR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 214 aa  42  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4046  LuxR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4320  LuxR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 266 aa  42.4  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.86 
 
 		 205 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4328  transcriptional regulator, LuxR family  35.14 
 
 		 260 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127099  normal  0.0225245 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4184  hypothetical protein  38.89 
 
 		 207 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.400045  normal  0.380291 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  25.13 
 
 		 210 aa  42  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0851  transcription regulator PRHJ transcription regulator protein  30.86 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.353607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  25.13 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1686  LuxR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 266 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3219  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.03 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3972  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 251 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.111106  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2354  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  42 
 
 		 236 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>