More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1677 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 		 479 aa  942    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  71.73 
 
 		 483 aa  683    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  72.07 
 
 		 481 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  45.76 
 
 		 483 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  48.05 
 
 		 483 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  43.91 
 
 		 481 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  45.05 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  45.05 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  45.05 
 
 		 484 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  46.61 
 
 		 483 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  46.83 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  46.39 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  46.39 
 
 		 483 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  43.88 
 
 		 483 aa  372  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  46.61 
 
 		 483 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  43.96 
 
 		 483 aa  363  4e-99  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  44.07 
 
 		 480 aa  361  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  44.77 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  44.32 
 
 		 483 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  43.94 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  42.77 
 
 		 492 aa  342  7e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  42.28 
 
 		 495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  35.02 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  37.29 
 
 		 477 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  36.65 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  36.65 
 
 		 479 aa  293  6e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  37.08 
 
 		 477 aa  292  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  36.65 
 
 		 479 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  36.65 
 
 		 479 aa  292  9e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  36.65 
 
 		 479 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  36.65 
 
 		 479 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  37.1 
 
 		 487 aa  292  1e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  37.08 
 
 		 477 aa  292  1e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  38.02 
 
 		 477 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  37.34 
 
 		 477 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  31.81 
 
 		 496 aa  239  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  33.33 
 
 		 540 aa  230  5e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  34.23 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  29.44 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.88 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  29.18 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2845  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  28.36 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  28.75 
 
 		 492 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.43 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  27.77 
 
 		 493 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  28.54 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  28.43 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  28.75 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  28.54 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  28.54 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  28.43 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  28.43 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  28.54 
 
 		 492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  28.22 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  28.22 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  28.54 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  27.31 
 
 		 483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  28.16 
 
 		 492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  28.05 
 
 		 492 aa  127  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  26.93 
 
 		 488 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2608  sodium/proline symporter  28.51 
 
 		 483 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0498264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  28.48 
 
 		 492 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  27.77 
 
 		 484 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1229  sodium/proline symporter  26.93 
 
 		 504 aa  124  5e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  25.98 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  25.97 
 
 		 486 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.81 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  24.9 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0491  sodium/proline symporter  26.08 
 
 		 495 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.94 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  26.75 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  28.63 
 
 		 488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.19 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  28.22 
 
 		 529 aa  120  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  27.25 
 
 		 483 aa  120  7e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  25.2 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  25.98 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1939  sodium/proline symporter  29.24 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  24.62 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  26.89 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.85 
 
 		 492 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  24.78 
 
 		 493 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  28.32 
 
 		 492 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.89 
 
 		 484 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  27.95 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4529  Na+/solute symporter  29.15 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.25 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1156  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 486 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.307204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  28.36 
 
 		 493 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>