More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1350 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1350  flagellar hook-associated protein FlgL  100 
 
 
400 aa  801    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3239  flagellar hook-associated protein FlgL  63.52 
 
 
403 aa  526  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2952  flagellar hook-associated protein FlgL  63.03 
 
 
403 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2587  flagellar hook-associated protein FlgL  63.03 
 
 
403 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1426  flagellar hook-associated protein FlgL  62.28 
 
 
403 aa  518  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1331  flagellar hook-associated protein FlgL  62.53 
 
 
403 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  0.0994213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2308  flagellar hook-associated protein FlgL  60.85 
 
 
401 aa  518  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2937  flagellar hook-associated protein FlgL  62.03 
 
 
403 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  62.03 
 
 
403 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1355  flagellar hook-associated protein FlgL  61.85 
 
 
396 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1607  flagellar hook-associated protein FlgL  60.35 
 
 
396 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.756895  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3077  flagellar hook-associated protein FlgL  61.35 
 
 
396 aa  495  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1171  flagellar hook-associated protein FlgL  58.6 
 
 
401 aa  475  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1313  flagellar hook-associated protein FlgL  59.1 
 
 
400 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1269  flagellar hook-associated protein FlgL  57.82 
 
 
402 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1339  flagellar hook-associated protein FlgL  56.82 
 
 
402 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1487  flagellar hook-associated protein FlgL  35.44 
 
 
406 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.893149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2328  flagellar hook-associated protein FlgL  30.5 
 
 
397 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01298  flagellar hook-associated protein FlgL  29.68 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1112  flagellar hook-associated protein FlgL  32.85 
 
 
410 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00867916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0903  flagellar hook-associated protein 3  31.96 
 
 
408 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.432658  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1782  flagellar hook-associated protein FlgL  29.68 
 
 
397 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.857694  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1896  flagellar hook-associated protein FlgL  30.35 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.664262  normal  0.100262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3744  flagellar hook-associated protein FlgL  29.74 
 
 
412 aa  172  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004163  flagellar hook-associated protein FlgL  29.07 
 
 
397 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
411 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5635  flagellar hook-associated protein FlgL  30.36 
 
 
404 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1234  flagellar hook-associated protein FlgL  28.78 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2368  flagellin-like  28.78 
 
 
400 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24100  flagellar hook-associated protein FlgL  31.96 
 
 
401 aa  160  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0510  flagellar hook-associated protein 3  29.11 
 
 
420 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.796621  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1227  flagellar hook-associated protein 3  28.54 
 
 
400 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.31859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01002  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 
401 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0789594  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06164  flagellar hook-associated protein FlgL  27.63 
 
 
401 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.80798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4181  flagellar hook-associated protein FlgL  29.51 
 
 
403 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0559  flagellar hook-associated protein 3  28.54 
 
 
417 aa  149  9e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.981861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2959  flagellar hook-associated protein FlgL  29.98 
 
 
406 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.146319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2724  flagellar hook-associated protein 3  27.29 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000113698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1968  flagellar hook-associated protein FlgL  27.88 
 
 
410 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0289  flagellar hook-associated protein FlgL  28.67 
 
 
410 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3063  flagellin-related hook-associated protein  29.21 
 
 
398 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154617  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50340  flagellar hook-associated protein FlgL  27.84 
 
 
439 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457191 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3336  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
410 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0475  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
410 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0277  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
410 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3343  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
410 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2088  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
410 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3005  flagellar hook-associated protein FlgL  28.57 
 
 
410 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.659687  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0251  flagellar hook-associated protein FlgL  27.69 
 
 
410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3009  flagellar hook-associated protein FlgL  28.71 
 
 
411 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0151  flagellar hook-associated protein FlgL  31.21 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.838516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3783  flagellar hook-associated protein FlgL  30.62 
 
 
407 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02918  flagellar hook-associated protein FlgL  28.1 
 
 
404 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.432868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0936  flagellar hook-associated protein 3  29.05 
 
 
416 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.415465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6360  flagellar hook-associated protein FlgL  29.04 
 
 
413 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4290  flagellar hook-associated protein FlgL  26.79 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3059  flagellar hook-associated protein FlgL  29.04 
 
 
413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0623  flagellar hook-associated protein 3  24.63 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3033  flagellar hook-associated protein FlgL  26.62 
 
 
411 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2400  flagellar hook-associated protein FlgL  26.01 
 
 
411 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3014  flagellar hook-associated protein FlgL  26.01 
 
 
411 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00481401  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3090  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2924  flagellar hook-associated protein FlgL  28.47 
 
 
413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.777627 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4431  flagellar hook-associated protein 3  26.23 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1627  flagellar hook-associated protein FlgL  36.41 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3724  flagellin-like  26.73 
 
 
410 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3838  flagellar hook-associated protein 3  25.24 
 
 
420 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1507  flagellar hook-associated protein FlgL  31.4 
 
 
523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3111  flagellar hook-associated protein 3  25.18 
 
 
420 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0059  flagellar hook-associated protein 3  36.21 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2840  flagellar hook-associated protein FlgL  34.92 
 
 
562 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.878588  normal  0.22747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2914  flagellar hook-associated protein FlgL  31.09 
 
 
302 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.481604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3721  flagellar hook-associated protein FlgL  29.71 
 
 
524 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4380  flagellar hook-associated protein FlgL  33.51 
 
 
521 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2203  flagellin-like protein  33.5 
 
 
532 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1945  flagellar hook-associated protein FlgL  29.02 
 
 
530 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0770249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3470  flagellar hook-associated protein FlgL  29.6 
 
 
530 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1475  flagellar hook-associated protein FlgL  30.14 
 
 
521 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649013  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1206  flagellar hook-associated protein FlgL  31.22 
 
 
317 aa  100  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0674951  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1281  flagellar hook-associated protein FlgL  35.62 
 
 
317 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  hitchhiker  0.000108184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1252  flagellar hook-associated protein FlgL  35.62 
 
 
317 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724059  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1296  flagellar hook-associated protein FlgL  35.62 
 
 
317 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000479805 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1464  flagellin-like  30.15 
 
 
341 aa  100  5e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2004  flagellar hook-associated protein FlgL  35.62 
 
 
317 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0025359  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2188  flagellar hook-associated protein FlgL  35.62 
 
 
317 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101663 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01079  flagellar hook-associated protein L  31.22 
 
 
317 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0213586  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2563  flagellar hook-associated protein 3  30.77 
 
 
317 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000663156  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2242  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
317 aa  99  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0269991  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2517  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
317 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0270874  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1462  flagellar hook-associated protein FlgL  31.22 
 
 
317 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00628542  hitchhiker  0.000000476574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1206  flagellar hook-associated protein FlgL  30.77 
 
 
317 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2588  flagellar hook-associated protein FlgL  32.61 
 
 
317 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2960  flagellar hook-associated protein 3  32.61 
 
 
319 aa  96.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0759  flagellar hook-associated protein FlgL  28.85 
 
 
326 aa  96.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.847019  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1331  flagellar hook-associated protein FlgL  32.12 
 
 
311 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1964  flagellar hook-associated protein FlgL  30.6 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0065  flagellar hook-associated protein 3  32.46 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4681  flagellar hook-associated protein 3  29.62 
 
 
304 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.399467  hitchhiker  0.00000747775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2045  flagellar hook-associated protein FlgL  29.41 
 
 
317 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0140515  normal  0.0179401 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0747  flagellar hook-associated protein FlgL  35.98 
 
 
305 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>