More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1048 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0884  signal recognition particle protein  77.24 
 
 
453 aa  675  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138728  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03481  hypothetical protein  80.09 
 
 
460 aa  644  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3402  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.54 
 
 
458 aa  647  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.625555 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2999  signal recognition particle protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000534435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15960  signal recognition particle protein Ffh  74.45 
 
 
457 aa  655  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.144741  normal  0.536445 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3230  signal recognition particle protein  77.24 
 
 
453 aa  675  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0218227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1253  signal recognition particle protein  92.12 
 
 
457 aa  800  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.79157e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2891  signal recognition particle protein  77.68 
 
 
453 aa  687  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0766211  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1253  signal recognition particle protein  94.31 
 
 
457 aa  855  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  4.9947e-07  hitchhiker  7.52283e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2893  signal recognition particle protein  77.68 
 
 
453 aa  687  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0469323  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2873  signal recognition particle protein  77.68 
 
 
453 aa  687  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110714  normal  0.0858138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2839  signal recognition particle protein  90.59 
 
 
457 aa  788  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  1.24707e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01690  signal recognition particle protein  77.46 
 
 
478 aa  683  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00271283  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2823  signal recognition particle protein  77.68 
 
 
453 aa  687  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00851471  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1373  signal recognition particle protein Ffh  74.23 
 
 
457 aa  655  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2769  signal recognition particle protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11534e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2921  signal recognition particle protein  91.47 
 
 
457 aa  817  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00726192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1670  signal recognition particle protein  77.4 
 
 
458 aa  700  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1066  signal recognition particle protein  75 
 
 
458 aa  645  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3365  signal recognition particle protein  77.02 
 
 
453 aa  674  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.089536  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1286  signal recognition particle protein  92.34 
 
 
457 aa  772  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.71618e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1073  signal recognition particle protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0286434  normal  0.0192406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1048  signal recognition particle protein  100 
 
 
457 aa  917  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  1.96553e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2762  signal recognition particle protein  76.59 
 
 
453 aa  677  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00925068  normal  0.0680462 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0851  signal recognition particle protein  78.64 
 
 
453 aa  659  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  1.29048e-05  hitchhiker  2.34744e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4158  signal recognition particle protein  75.45 
 
 
458 aa  647  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23319  normal  0.485937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2755  signal recognition particle protein  91.9 
 
 
457 aa  807  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.03773e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1427  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  74.83 
 
 
458 aa  655  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0277163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1158  signal recognition particle protein  92.78 
 
 
457 aa  840  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  6.42448e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2894  signal recognition particle protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  3.333e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2921  signal recognition particle protein  90.37 
 
 
457 aa  788  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000450795  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3005  signal recognition particle protein  77.68 
 
 
453 aa  687  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02499  Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39570  signal recognition particle protein  74.61 
 
 
458 aa  681  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2861  signal recognition particle protein  76.37 
 
 
453 aa  694  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1356  signal recognition particle protein  90.59 
 
 
457 aa  788  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02463  hypothetical protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0990  signal recognition particle protein  76.15 
 
 
453 aa  674  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00945365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4073  signal recognition particle protein  78.38 
 
 
463 aa  713  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3204  signal recognition particle protein  76.15 
 
 
453 aa  669  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0069181  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1123  signal recognition particle protein  76.15 
 
 
453 aa  667  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.279052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002535  signal recognition particle subunit Ffh SRP54  80.33 
 
 
460 aa  644  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1461  signal recognition particle protein  74.77 
 
 
538 aa  642  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0499912  normal  0.21727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1209  signal recognition particle protein  92.56 
 
 
457 aa  773  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.38593e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1064  signal recognition particle protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.03805e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2311  signal recognition particle protein  73.9 
 
 
485 aa  653  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3368  signal recognition particle protein  78.71 
 
 
457 aa  673  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0888  signal recognition particle protein  90.81 
 
 
457 aa  824  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  1.42989e-05  normal  0.373446 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1018  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  73.85 
 
 
458 aa  644  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.868706  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4260  signal recognition particle protein  74.77 
 
 
458 aa  644  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0648  signal recognition particle protein  77.96 
 
 
461 aa  651  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.773728  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3849  signal recognition particle protein  76.81 
 
 
453 aa  680  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  6.05639e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0094  signal recognition particle protein  78.67 
 
 
461 aa  640  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.25089e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3018  signal recognition particle protein  90.59 
 
 
457 aa  788  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  3.9159e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3104  signal recognition particle protein  92.56 
 
 
457 aa  773  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.41877e-05  normal  0.0737294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1167  signal recognition particle protein  91.9 
 
 
457 aa  773  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000256544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3091  signal recognition particle protein  78.17 
 
 
453 aa  673  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113189  normal  0.0737969 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1062  signal recognition particle protein  94.31 
 
 
457 aa  874  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0147174  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2261  Signal recognition particle protein  71.02 
 
 
452 aa  630  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0845  signal recognition particle protein  71.4 
 
 
453 aa  625  1e-178  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1338  signal recognition particle protein  67.69 
 
 
452 aa  623  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1281  Signal recognition particle protein  72.48 
 
 
458 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1472  signal recognition particle protein Ffh  72.25 
 
 
458 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0337411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1202  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54) / transcription elongation factor GreB  70.21 
 
 
495 aa  615  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0352571  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0384  signal recognition particle protein  67.84 
 
 
451 aa  611  1e-174  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3771  signal recognition particle protein  72.85 
 
 
460 aa  610  1e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000572875  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0467  hypothetical protein  66.22 
 
 
458 aa  602  1e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0443  hypothetical protein  66.22 
 
 
458 aa  602  1e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0998  signal recognition particle protein  67.98 
 
 
459 aa  603  1e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0426  signal recognition particle protein  67.87 
 
 
462 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1178  signal recognition particle protein  64.27 
 
 
456 aa  591  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.520274  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0592  signal recognition particle protein  64.94 
 
 
515 aa  586  1e-166  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1707  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.08 
 
 
511 aa  579  1e-164  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0983445  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3017  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  73.08 
 
 
474 aa  581  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0662869  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1985  signal recognition particle protein  64.21 
 
 
515 aa  575  1e-163  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.421506  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0199  signal recognition particle protein  60.36 
 
 
449 aa  577  1e-163  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3517  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3268  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3479  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0436  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3515  signal recognition particle protein  62.36 
 
 
455 aa  572  1e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1295  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2514  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1938  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  67.94 
 
 
456 aa  573  1e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.730231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1149  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  574  1e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0493  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2793  signal recognition particle protein  62.47 
 
 
455 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634581  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0516  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  62.8 
 
 
455 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0518  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.034328  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0642  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  64.27 
 
 
455 aa  570  1e-161  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.821014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3440  signal recognition particle protein  62.58 
 
 
455 aa  568  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000127392  hitchhiker  0.000711681 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0108  signal recognition particle protein  61.93 
 
 
455 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0560  signal recognition particle protein  62.14 
 
 
455 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.276011  hitchhiker  0.000299171 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2477  signal recognition particle protein  62.06 
 
 
458 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0590  signal recognition particle protein  61.93 
 
 
455 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2856  signal recognition particle protein  62.06 
 
 
458 aa  566  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3675  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.71 
 
 
455 aa  563  1e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460625  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0522  signal recognition particle subunit FFH/SRP54 (srp54)  61.79 
 
 
450 aa  561  1e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.823996  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02143  signal recognition particle protein  66.74 
 
 
460 aa  551  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0559  signal recognition particle protein  58.91 
 
 
461 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.06608e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>