More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5050 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  100 
 
 		 341 aa  682    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  76.83 
 
 		 342 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  76.25 
 
 		 342 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  76.83 
 
 		 341 aa  535  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  75.37 
 
 		 341 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  73.9 
 
 		 341 aa  524  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  75.07 
 
 		 341 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  77.13 
 
 		 346 aa  521  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  75.66 
 
 		 341 aa  518  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  73.9 
 
 		 341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  75.66 
 
 		 342 aa  513  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  73.39 
 
 		 342 aa  497  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  72.43 
 
 		 341 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  70.97 
 
 		 341 aa  481  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  70.09 
 
 		 340 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  60.82 
 
 		 340 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  61.29 
 
 		 344 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  58.06 
 
 		 341 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  61.7 
 
 		 342 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  58.72 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  58.65 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  58.43 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  58.43 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  58.43 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  58.43 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  58.72 
 
 		 345 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  56.98 
 
 		 343 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  56.3 
 
 		 344 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  55.03 
 
 		 339 aa  368  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  56.18 
 
 		 348 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  55.94 
 
 		 349 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  56.85 
 
 		 342 aa  361  1e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  57.4 
 
 		 343 aa  355  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  52.35 
 
 		 343 aa  349  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  50.88 
 
 		 341 aa  347  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  51.18 
 
 		 341 aa  347  2e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  53.78 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  49.41 
 
 		 340 aa  335  5.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  52.2 
 
 		 368 aa  335  5.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  52.01 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  50.88 
 
 		 363 aa  328  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  54.09 
 
 		 364 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  49.42 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  49.85 
 
 		 365 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  51.46 
 
 		 370 aa  321  9.000000000000001e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  50.44 
 
 		 373 aa  318  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  50.6 
 
 		 358 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  50 
 
 		 360 aa  311  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  51.8 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  48.53 
 
 		 363 aa  306  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  48.24 
 
 		 368 aa  306  4.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  47.97 
 
 		 363 aa  305  5.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  52.07 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  47.67 
 
 		 366 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  47.52 
 
 		 370 aa  300  2e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  47.38 
 
 		 365 aa  298  6e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  45.88 
 
 		 362 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  51 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  48.87 
 
 		 367 aa  293  4e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  49.57 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  49.85 
 
 		 375 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  49.55 
 
 		 351 aa  285  5.999999999999999e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  47.67 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  46.89 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  43.75 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  50.15 
 
 		 342 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  45.07 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  47.25 
 
 		 365 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  46.78 
 
 		 364 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  46.47 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  45.65 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  43.86 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000000838364  decreased coverage  0.000000000440972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  42.81 
 
 		 350 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  42.51 
 
 		 350 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  47.16 
 
 		 369 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  46.29 
 
 		 368 aa  258  7e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  44.23 
 
 		 378 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  42.11 
 
 		 360 aa  257  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  42.2 
 
 		 322 aa  256  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.82 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  44.82 
 
 		 319 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  44.82 
 
 		 319 aa  245  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  44.81 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0739  6-phosphofructokinase  42.25 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  41.72 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  44.09 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  44.09 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0715  6-phosphofructokinase  41.95 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  43.27 
 
 		 322 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  38.05 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  39.71 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  43.57 
 
 		 322 aa  236  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0938  6-phosphofructokinase  41.3 
 
 		 319 aa  235  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  40.9 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0591  6-phosphofructokinase  40.49 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  41.74 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  41.74 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1661  6-phosphofructokinase  41.28 
 
 		 335 aa  227  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0169  6-phosphofructokinase  42.18 
 
 		 323 aa  228  2e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2068  6-phosphofructokinase  39.23 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>