More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1187 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1187  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 		 104 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.102596 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04000  50S ribosomal protein L23  68.27 
 
 		 103 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  60.19 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  67.35 
 
 		 96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6612  50S ribosomal protein L23  61.62 
 
 		 99 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  62.24 
 
 		 98 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  61.86 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  66.67 
 
 		 99 aa  124  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6047  50S ribosomal protein L23  63.92 
 
 		 98 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  63.92 
 
 		 98 aa  123  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10717  50S ribosomal protein L23  60.4 
 
 		 100 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.215764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  61.9 
 
 		 101 aa  121  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  63.54 
 
 		 100 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5126  Ribosomal protein L25/L23  64.58 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  62.89 
 
 		 100 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0308  50S ribosomal protein L23P  61.22 
 
 		 98 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23790  LSU ribosomal protein L23P  60.82 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4313  ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689927  hitchhiker  0.00977905 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2685  50S ribosomal protein L23  55.77 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.85807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2973  50S ribosomal protein L23  55.77 
 
 		 101 aa  117  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.505088  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0629  Ribosomal protein L25/L23  61.17 
 
 		 100 aa  116  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0933  Ribosomal protein L25/L23  64 
 
 		 111 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  60 
 
 		 100 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  63.27 
 
 		 101 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1042  50S ribosomal protein L23  57.43 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1015  50S ribosomal protein L23  57.43 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.509304  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1032  50S ribosomal protein L23  57.43 
 
 		 100 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  58.82 
 
 		 103 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5047  50S ribosomal protein L23  58.51 
 
 		 100 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185864  normal  0.262037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0690  Ribosomal protein L25/L23  59.18 
 
 		 103 aa  112  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29720  LSU ribosomal protein L23P  58.25 
 
 		 101 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.363975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1307  50S ribosomal protein L23  56.7 
 
 		 100 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.433832  normal  0.153426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2657  Ribosomal protein L25/L23  59.79 
 
 		 100 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0589  Ribosomal protein L25/L23  59.18 
 
 		 100 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.185358  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4505  Ribosomal protein L25/L23  58 
 
 		 100 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20850  LSU ribosomal protein L23P  62.96 
 
 		 107 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  56.12 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1572  Ribosomal protein L25/L23  56.38 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000483803  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  54.08 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  54.64 
 
 		 95 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 		 94 aa  92.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  56.47 
 
 		 93 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  52.81 
 
 		 95 aa  88.6  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  54.08 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  51.69 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  53.93 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 		 95 aa  82.8  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  50.55 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  50 
 
 		 94 aa  81.3  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 		 97 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  46.15 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 		 99 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  52.94 
 
 		 98 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  55.13 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  55.13 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0424  50S ribosomal protein L23  54.32 
 
 		 95 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000240996  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  46.81 
 
 		 99 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3665  ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 99 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  53.85 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 		 98 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  53.57 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  47.78 
 
 		 96 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 		 98 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  51.09 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  47.87 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  51.16 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  43.16 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  53.85 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 100 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  52.56 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  52.56 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  52.56 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  47.62 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  50.6 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0109  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  48.84 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 97 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0113  50S ribosomal protein L23  43.62 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000241418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  48.81 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  48.91 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0293  50S ribosomal protein L23  44.71 
 
 		 98 aa  73.2  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  45.35 
 
 		 100 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  50 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  53.16 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  51.28 
 
 		 97 aa  72  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  53.03 
 
 		 98 aa  72.8  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0983  Ribosomal protein L25/L23  47.56 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.285455  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2617  50S ribosomal protein L25/L23  52.5 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0277949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0106  50S ribosomal protein L23  42.55 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000244838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3010  50S ribosomal protein L23  45.88 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00732369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  51.28 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  44.19 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>