275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0070 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  617  1e-176  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  78.25 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  77.19 
 
 		 288 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  75.44 
 
 		 292 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  72.22 
 
 		 279 aa  419  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  71.11 
 
 		 276 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  71.11 
 
 		 279 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  71.48 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  65.35 
 
 		 272 aa  356  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  61.45 
 
 		 274 aa  346  3e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  62.08 
 
 		 268 aa  343  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  60.51 
 
 		 285 aa  340  1e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  61.34 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  61.98 
 
 		 284 aa  333  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  61.6 
 
 		 279 aa  311  5.999999999999999e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  63.49 
 
 		 282 aa  309  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  57.82 
 
 		 291 aa  305  9.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  57.75 
 
 		 292 aa  298  8e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  54.61 
 
 		 305 aa  294  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  51.01 
 
 		 299 aa  292  6e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  52.82 
 
 		 297 aa  288  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  58.75 
 
 		 302 aa  288  8e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  52.26 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  55.81 
 
 		 301 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  50.75 
 
 		 287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  49.81 
 
 		 288 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  52.17 
 
 		 287 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  50.96 
 
 		 299 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  49.43 
 
 		 288 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  48.68 
 
 		 287 aa  258  6e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  44.75 
 
 		 287 aa  257  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  49.41 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  46.62 
 
 		 287 aa  255  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  47.33 
 
 		 284 aa  253  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  48.35 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  46.54 
 
 		 288 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  46.33 
 
 		 282 aa  248  6e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  43.88 
 
 		 282 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  50.2 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  46.15 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  48.41 
 
 		 273 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  47.73 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  45.77 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  46.79 
 
 		 270 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  45.98 
 
 		 291 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  48.39 
 
 		 261 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  48.28 
 
 		 318 aa  235  7e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  48.28 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  48.28 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  48.28 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  46.04 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  47.04 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  47.89 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  47.89 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  47.89 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  44.11 
 
 		 294 aa  229  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  44.02 
 
 		 342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  40.58 
 
 		 342 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  44.44 
 
 		 271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  41.7 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  40.62 
 
 		 318 aa  192  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  50 
 
 		 175 aa  187  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  55.22 
 
 		 147 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  46.82 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  37.97 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  44.91 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  42.69 
 
 		 229 aa  152  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  38.63 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  40.34 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  48.47 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  44.79 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  44.79 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  44.79 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  44.79 
 
 		 252 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  39.33 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  44.79 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  44.71 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  44.44 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  44.79 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  42.11 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  37.5 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  39.91 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  43.86 
 
 		 245 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 249 aa  145  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  43.11 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  37.92 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  41.18 
 
 		 242 aa  145  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  38.46 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  43.56 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 249 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  41.62 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  38.36 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  43.56 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  42.7 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  42.46 
 
 		 317 aa  143  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  41.67 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>