156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3226 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3226  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
185 aa  387  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.352328  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2510  flavin reductase domain protein FMN-binding  57.78 
 
 
186 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.365491  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3753  flavin reductase-like, FMN-binding  60.56 
 
 
186 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.722732  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7416  hypothetical protein  56.11 
 
 
188 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.933873  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5713  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.35 
 
 
189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3128  flavin reductase domain-containing protein  52.97 
 
 
185 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0124  flavin reductase domain protein FMN-binding  49.46 
 
 
186 aa  203  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0524  hypothetical protein  52.27 
 
 
184 aa  198  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000440007  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1925  flavin reductase-like protein  43.82 
 
 
178 aa  174  7e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.802506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0519  flavin reductase domain-containing protein  46.29 
 
 
176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3722  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.57 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40150  Flavin reductase-like protein  49.41 
 
 
177 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.710187  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3068  flavin reductase domain-containing protein  46.06 
 
 
176 aa  167  8e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.441099 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1916  putative flavin reductase-like protein  45.71 
 
 
177 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0609748  normal  0.257395 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0862  flavin reductase-like, FMN-binding  40.45 
 
 
178 aa  158  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.374228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1289  flavin reductase domain protein FMN-binding  60 
 
 
123 aa  158  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0590  hypothetical protein  46.02 
 
 
185 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5217  flavin reductase domain-containing protein  42.53 
 
 
182 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2498  flavin reductase domain-containing protein  37.43 
 
 
180 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.198101  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1944  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.46 
 
 
180 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.334773  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1739  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.87 
 
 
180 aa  131  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1062  flavin reductase domain-containing protein  39.11 
 
 
180 aa  131  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1187  hypothetical protein  40.83 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2664  flavin reductase domain protein FMN-binding  40.46 
 
 
180 aa  129  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1600  hypothetical protein  38.42 
 
 
185 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3733  hypothetical protein  38.75 
 
 
160 aa  117  9e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
205 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  36.07 
 
 
202 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.16 
 
 
215 aa  99  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.78 
 
 
193 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.78 
 
 
225 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  32.11 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  31.38 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.56 
 
 
197 aa  91.3  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  35.33 
 
 
208 aa  90.9  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1327  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
192 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.646818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2040  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.09 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.228084  hitchhiker  0.0000000489831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0249  putative flavin reductase  29.07 
 
 
195 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688531  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.58 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0980  flavin reductase domain-containing protein  31.84 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.07 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.19 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2072  flavin reductase domain-containing protein  32.97 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3881  flavin reductase domain-containing protein  30.66 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1661  flavoredoxin  29.32 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.600705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1399  flavin reductase, putative  29.32 
 
 
192 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0187374  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2311  flavin reductase domain-containing protein  30.66 
 
 
180 aa  71.2  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.833881  hitchhiker  0.000888087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01420  hypothetical protein  28.96 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1232  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.34 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01432  hypothetical protein  28.96 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1643  flavin reductase domain-containing protein  28.96 
 
 
189 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2185  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.98 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00717772  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1546  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.917994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2194  flavin reductase domain-containing protein  29.89 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  27.59 
 
 
183 aa  69.3  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1712  flavin reductase domain-containing protein  30.05 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.0473113 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  29.2 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  26.7 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1850  hypothetical protein  27.01 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.147622 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2155  flavin reductase domain-containing protein  30.34 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2659  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  28.41 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.125103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  24.29 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  29.46 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.43 
 
 
185 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4577  flavin reductase domain-containing protein  28.41 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2393  flavin reductase-like  27.84 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791312  normal  0.804831 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02270  conserved protein of DIM6/NTAB family  25.9 
 
 
168 aa  63.2  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.759277  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0014  flavin reductase domain-containing protein  26.76 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0805  flavin reductase-like, FMN-binding  30.83 
 
 
188 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0359  flavin reductase domain-containing protein  30 
 
 
195 aa  61.2  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184245 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2781  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  21.38 
 
 
167 aa  61.2  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373643  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0401  flavin reductase domain-containing protein  28.24 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2846  flavin reductase domain-containing protein  28.96 
 
 
200 aa  59.7  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000500824  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0626  flavin reductase domain-containing protein  26.29 
 
 
198 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2036  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.43 
 
 
190 aa  57.8  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000423527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0720  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.98 
 
 
195 aa  57.8  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1998  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.74 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0699  hypothetical protein  26.74 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0606  flavin reductase family protein  26.74 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.37 
 
 
215 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2701  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.57 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0078  flavoredoxin  32.58 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00025705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1572  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.2 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0687  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.7 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0347  flavin reductase domain-containing protein  28.68 
 
 
191 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.643208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.13 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3891  flavin reductase domain-containing protein  28.02 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.824714  normal  0.0240386 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2181  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.92 
 
 
190 aa  55.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1931  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0605182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3486  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.67 
 
 
192 aa  55.5  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0224  FMN-binding protein  28.75 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114733  normal  0.756324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3444  flavin reductase domain-containing protein  27.21 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  unclonable  0.00000709652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1144  flavin reductase-like, FMN-binding  28.35 
 
 
189 aa  54.7  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.467484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4508  flavin reductase-like, FMN-binding  29.61 
 
 
194 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0883  flavin reductase-like, FMN-binding  28.41 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.519156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1365  flavin reductase domain-containing protein  28.41 
 
 
196 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1343  flavin reductase domain-containing protein  27.84 
 
 
196 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1242  flavin reductase domain-containing protein  27.84 
 
 
192 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.877507  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0126  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.82 
 
 
194 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>