96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0056 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_16860  glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.4 
 
 
834 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00942746  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0056  glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
878 aa  1785    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.753755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.18 
 
 
828 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379419  normal  0.651671 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03607  glycerol-3-phosphate acyltransferase  84.69 
 
 
886 aa  1510    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4203  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.22 
 
 
828 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.328155 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1520  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43 
 
 
833 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1328  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.34 
 
 
833 aa  641    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0851055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1466  glycerol-3-phosphate acyltransferase  44.21 
 
 
834 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.077287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1084  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.02 
 
 
834 aa  655    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0310  glycerol-3-phosphate acyltransferase  77.47 
 
 
863 aa  1365    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0345  glycerol-3-phosphate acyltransferase  77.93 
 
 
863 aa  1367    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.327765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4098  glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.87 
 
 
828 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227431  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3091  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.57 
 
 
827 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191573  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1126  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.25 
 
 
828 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.34599  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2228  glycerol-3-phosphate acyltransferase  42.89 
 
 
823 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.66 
 
 
838 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0134  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.62 
 
 
930 aa  531  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0908404  normal  0.57314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0145  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.69 
 
 
930 aa  528  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3530  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.22 
 
 
807 aa  524  1e-147  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225343  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3514  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.1 
 
 
807 aa  520  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3861  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.57 
 
 
807 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.761394  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3988  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.31 
 
 
807 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.740194  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3788  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.44 
 
 
807 aa  512  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3779  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.44 
 
 
807 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4602  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.44 
 
 
809 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0157  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.08 
 
 
807 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4308  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.08 
 
 
807 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2422  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.27 
 
 
811 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4177  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.08 
 
 
807 aa  505  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4462  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.24 
 
 
821 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4109  glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.08 
 
 
807 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3772  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.66 
 
 
825 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00269  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.19 
 
 
790 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0245  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.78 
 
 
806 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.659891  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002147  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.57 
 
 
758 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3862  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.66 
 
 
828 aa  502  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4578  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.65 
 
 
806 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153091  normal  0.0823596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3526  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.49 
 
 
825 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3400  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.21 
 
 
827 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.841404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4577  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.65 
 
 
806 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4427  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.65 
 
 
806 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489511 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4492  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.65 
 
 
806 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.32327  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4629  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.65 
 
 
806 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.201291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2894  glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.84 
 
 
807 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.89885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4594  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.62 
 
 
807 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.503776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3952  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  38.62 
 
 
807 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4556  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.49 
 
 
807 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.49 
 
 
827 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3987  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.62 
 
 
807 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3996  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.09 
 
 
807 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4281  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.62 
 
 
807 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4248  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  35.85 
 
 
811 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5522  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.75 
 
 
807 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.222297  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03913  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.62 
 
 
807 aa  495  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.818357  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3480  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.52 
 
 
807 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0201  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.87 
 
 
807 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0181  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.53 
 
 
807 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0731  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.66 
 
 
822 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.358742  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0261  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.32 
 
 
807 aa  481  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04015  glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.32 
 
 
818 aa  480  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0385  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.09 
 
 
811 aa  479  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0512  glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.27 
 
 
822 aa  476  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0165  glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.61 
 
 
944 aa  436  1e-121  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.388092  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0133  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.33 
 
 
811 aa  419  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0020  glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.86 
 
 
821 aa  390  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0194  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  30.6 
 
 
799 aa  372  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2476  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  36.53 
 
 
869 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.930155  normal  0.326716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1991  glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  27.03 
 
 
881 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0003746  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2667  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  32.81 
 
 
866 aa  242  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2571  Glycerol-3-phosphate O-acyltransferase  35.37 
 
 
866 aa  241  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1289  glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.08 
 
 
867 aa  224  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153054  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3097  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.34 
 
 
887 aa  223  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00206  acyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11030)  30.33 
 
 
806 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0934118  normal  0.404402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4652  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.62 
 
 
750 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3691  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.06 
 
 
790 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.103216  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3623  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.06 
 
 
790 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.910554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3618  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.06 
 
 
790 aa  134  9e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12503  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.01 
 
 
789 aa  128  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4074  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.39 
 
 
783 aa  126  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204075  normal  0.946576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2565  glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.25 
 
 
783 aa  121  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.302237 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59314  predicted protein  36.65 
 
 
811 aa  114  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0795  glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.81 
 
 
495 aa  105  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0194  glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.42 
 
 
783 aa  105  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.36 
 
 
480 aa  105  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11583  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.12 
 
 
621 aa  103  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.665095 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3105  glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.78 
 
 
476 aa  96.3  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5001  glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.16 
 
 
623 aa  94  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44189  predicted protein  26.3 
 
 
1560 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3150  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.03 
 
 
548 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142438  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1526  sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.56 
 
 
234 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000656832  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0020  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.24 
 
 
265 aa  47  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.398753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4719  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.71 
 
 
388 aa  47  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.301329  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0433  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.95 
 
 
213 aa  45.8  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0283  hypothetical protein  25.24 
 
 
551 aa  45.1  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1319  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase family protein  32.07 
 
 
234 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000000821958  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.11 
 
 
209 aa  45.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>