More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
223 aa  441  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  71.89 
 
 
224 aa  302  3.0000000000000004e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  66.82 
 
 
219 aa  279  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  61.32 
 
 
222 aa  257  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  59.81 
 
 
232 aa  245  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  53.02 
 
 
221 aa  224  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  52.36 
 
 
220 aa  218  7e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  52.38 
 
 
220 aa  217  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  48.87 
 
 
217 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  46.95 
 
 
214 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  47.87 
 
 
215 aa  203  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  47.62 
 
 
219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  46.51 
 
 
217 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 
222 aa  192  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  45.71 
 
 
220 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  49.05 
 
 
224 aa  186  3e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.47 
 
 
226 aa  184  8e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  46.45 
 
 
219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  44.76 
 
 
220 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.12 
 
 
220 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  43.84 
 
 
222 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  43.84 
 
 
222 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  43.84 
 
 
222 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  43.4 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  44.19 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  46.45 
 
 
218 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  43.13 
 
 
238 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 
220 aa  165  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  44.44 
 
 
222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.81 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  42.18 
 
 
220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.4 
 
 
226 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  44.29 
 
 
214 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
220 aa  151  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 
225 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 
214 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  42.18 
 
 
231 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  35.81 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 
216 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  39.34 
 
 
230 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 
215 aa  118  7.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
233 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 
217 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  35.4 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  30.45 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 
226 aa  109  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 
220 aa  108  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  34.82 
 
 
218 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
240 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 
236 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 
217 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  35.87 
 
 
236 aa  106  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 
220 aa  105  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  33.79 
 
 
239 aa  106  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.11 
 
 
238 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 
218 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 
236 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  27.19 
 
 
228 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  27.52 
 
 
218 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 
236 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 
237 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
223 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.06 
 
 
237 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 
237 aa  102  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
223 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 
239 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 
233 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.29 
 
 
228 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
228 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32.47 
 
 
242 aa  101  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  32.27 
 
 
243 aa  101  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  30.32 
 
 
242 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 
240 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 
240 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.84 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  31.84 
 
 
241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  32.46 
 
 
231 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  32.73 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.17 
 
 
240 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.17 
 
 
240 aa  99  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
226 aa  99  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  30.59 
 
 
240 aa  98.2  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 
238 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  31.05 
 
 
220 aa  98.2  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  30.1 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  29.36 
 
 
214 aa  98.2  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  29.81 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  31.53 
 
 
216 aa  96.3  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  26.76 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  27.5 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  32.46 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>