57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14860 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 278 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  46.32 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  41.07 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  37.15 
 
 		 301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  42.96 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  37.12 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  31.27 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  32.36 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  26.52 
 
 		 250 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  27.82 
 
 		 240 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  30.36 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  30.66 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  30.66 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  30.66 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  29.66 
 
 		 255 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  30.29 
 
 		 245 aa  89  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  29.55 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  29.93 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  29.93 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  29.93 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  30.47 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  26.17 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  28.82 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  30.98 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  31.88 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  28.91 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  29.41 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.54 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  28.12 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  25.56 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  28.3 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25.28 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  28.14 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  26.72 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  27.1 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  26.72 
 
 		 245 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  27.45 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  28.68 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  26.67 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  25.09 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  27.84 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  40 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  24.81 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  34.96 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  26.74 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  27.48 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  28.4 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  25.55 
 
 		 247 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  28.72 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  28.72 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  28.21 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  20.8 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  27.24 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  24.51 
 
 		 258 aa  43.1  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>