More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4345 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  83.78 
 
 		 561 aa  919    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  76.16 
 
 		 562 aa  812    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  71.09 
 
 		 467 aa  674    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  79.46 
 
 		 547 aa  859    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  93.05 
 
 		 561 aa  1016    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  92.87 
 
 		 561 aa  1014    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  93.05 
 
 		 561 aa  1031    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  84.42 
 
 		 565 aa  912    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  76.38 
 
 		 560 aa  825    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  79.21 
 
 		 562 aa  857    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  85.56 
 
 		 561 aa  932    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  79.96 
 
 		 562 aa  857    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  93.58 
 
 		 561 aa  1035    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  92.87 
 
 		 561 aa  1014    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  92.87 
 
 		 561 aa  1014    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  79.29 
 
 		 547 aa  856    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  70.66 
 
 		 503 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  84.78 
 
 		 564 aa  923    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  92.69 
 
 		 561 aa  1013    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  92.87 
 
 		 561 aa  1014    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  100 
 
 		 561 aa  1137    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  84.96 
 
 		 564 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  55.93 
 
 		 551 aa  616  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  67.88 
 
 		 468 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  55.69 
 
 		 550 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  67.45 
 
 		 468 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3488  putative mercuric reductase  55.64 
 
 		 552 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.852286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  58.24 
 
 		 541 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  61.42 
 
 		 479 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  53.99 
 
 		 479 aa  508  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0161  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  61.52 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  45.65 
 
 		 550 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  40.53 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  40.53 
 
 		 546 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  40.35 
 
 		 546 aa  388  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  48.18 
 
 		 767 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  43.86 
 
 		 546 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  47.16 
 
 		 475 aa  384  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  46.82 
 
 		 745 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  42.4 
 
 		 548 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  46.47 
 
 		 767 aa  369  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  46.09 
 
 		 479 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  44.83 
 
 		 457 aa  344  2.9999999999999997e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  46.78 
 
 		 481 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  41.42 
 
 		 557 aa  329  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  45.38 
 
 		 478 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  43.92 
 
 		 467 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  43.25 
 
 		 476 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  40.43 
 
 		 480 aa  314  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  41.78 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  41.78 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  41.78 
 
 		 476 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  43.12 
 
 		 476 aa  313  4.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  41.43 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  41.09 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  42.01 
 
 		 474 aa  307  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  42.23 
 
 		 474 aa  306  5.0000000000000004e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  40.68 
 
 		 468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  38.57 
 
 		 469 aa  295  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  38.17 
 
 		 469 aa  292  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.63 
 
 		 468 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  40.43 
 
 		 477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  37.85 
 
 		 453 aa  286  5e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  40.34 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.16 
 
 		 471 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  36.22 
 
 		 464 aa  276  1.0000000000000001e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  37.45 
 
 		 448 aa  275  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  35.79 
 
 		 449 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  38.44 
 
 		 484 aa  258  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  34.27 
 
 		 484 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.18 
 
 		 717 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.03 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  36.55 
 
 		 722 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.33 
 
 		 485 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.45 
 
 		 462 aa  237  3e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.61 
 
 		 471 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.12 
 
 		 475 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.12 
 
 		 475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.81 
 
 		 484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.41 
 
 		 482 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  33.84 
 
 		 704 aa  233  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.72 
 
 		 482 aa  233  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  33.14 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.33 
 
 		 466 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.87 
 
 		 460 aa  230  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  32.71 
 
 		 510 aa  229  7e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.19 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.17 
 
 		 480 aa  228  3e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  33.81 
 
 		 510 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  31.48 
 
 		 717 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  31.63 
 
 		 738 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.63 
 
 		 716 aa  226  7e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.2 
 
 		 717 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  34.91 
 
 		 470 aa  224  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  29.59 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1205  mercuric reductase  36.42 
 
 		 464 aa  223  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.295648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.15 
 
 		 470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 720 aa  219  7e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>