57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1311 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  891    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1336  hypothetical protein  59.21 
 
 		 431 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2613  hypothetical protein  52.93 
 
 		 429 aa  455  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.963488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2956  hypothetical protein  51.7 
 
 		 442 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1407  protein of unknown function DUF115  51.47 
 
 		 442 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3259  hypothetical protein  50.45 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1525  hypothetical protein  42.15 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2971  hypothetical protein  41.67 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3115  hypothetical protein  41.67 
 
 		 435 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0045  hypothetical protein  39.68 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3705  hypothetical protein  40 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.464956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1145  hypothetical protein  35.53 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001173  hypothetical protein  31.46 
 
 		 440 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0762  hypothetical protein  28.74 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1317  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 826 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1780  hypothetical protein  25.11 
 
 		 626 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3220  protein of unknown function DUF115  23.62 
 
 		 758 aa  71.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2630  hypothetical protein  25.86 
 
 		 821 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.227202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2233  hypothetical protein  21.65 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0669  protein of unknown function DUF115  25.28 
 
 		 891 aa  67.4  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1301  hypothetical protein  27.56 
 
 		 823 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.190749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0199  hypothetical protein  24.43 
 
 		 671 aa  63.2  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1340  motility accessory factor  24.81 
 
 		 608 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0166  motility accessory factor  23.63 
 
 		 617 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00679404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3273  hypothetical protein  25.45 
 
 		 822 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1575  hypothetical protein  23.97 
 
 		 833 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1044  protein of unknown function DUF115  24.32 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1395  protein of unknown function DUF115  25.11 
 
 		 820 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2165  hypothetical protein  28.36 
 
 		 833 aa  60.8  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3107  hypothetical protein  26.69 
 
 		 841 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17040  hypothetical protein  26.29 
 
 		 618 aa  59.7  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1917  protein of unknown function DUF115  27.24 
 
 		 616 aa  59.7  0.00000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2968  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 822 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1285  hypothetical protein  23.53 
 
 		 824 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0373  motility accessory factor  25.07 
 
 		 629 aa  55.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0043  hypothetical protein  25.49 
 
 		 825 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0162  motility accessory factor  25.2 
 
 		 570 aa  54.7  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.372876  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0627  protein of unknown function DUF115  25.81 
 
 		 871 aa  54.3  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4091  hypothetical protein  25.08 
 
 		 841 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1454  hypothetical protein  25.21 
 
 		 812 aa  53.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1028  hypothetical protein  35.11 
 
 		 238 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.273367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2337  hypothetical protein  26.32 
 
 		 826 aa  53.1  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.239446  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2149  protein of unknown function DUF115  26.23 
 
 		 577 aa  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1600  hypothetical protein  31.13 
 
 		 238 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1571  hypothetical protein  27.44 
 
 		 244 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0314  hypothetical protein  34.78 
 
 		 238 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0376  motility accessory factor  23.78 
 
 		 647 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0447  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 839 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0449  hypothetical protein  25.75 
 
 		 509 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0371  motility accessory factor  22.34 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1529  motility accessory factor  23.65 
 
 		 605 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1525  motility accessory factor  24.63 
 
 		 635 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3113  protein of unknown function DUF115  25.7 
 
 		 589 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213149 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0458  hypothetical protein  28.41 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1530  motility accessory factor  23.1 
 
 		 607 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.459783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1315  hypothetical protein  22.12 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0370  motility accessory factor  23.32 
 
 		 605 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>