More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0001 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  100 
 
 
450 aa  931    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.78 
 
 
460 aa  297  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 
450 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  33.19 
 
 
449 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  34 
 
 
445 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  32.9 
 
 
460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.65 
 
 
449 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
458 aa  272  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.07 
 
 
463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.96 
 
 
443 aa  266  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  34.79 
 
 
452 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0785  chromosomal replication initiator protein DnaA  33.62 
 
 
460 aa  265  1e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 
446 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 
446 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 
446 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 
446 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  32.51 
 
 
446 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
446 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
446 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  32.43 
 
 
443 aa  260  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  32.57 
 
 
446 aa  260  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.27 
 
 
449 aa  259  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  32.57 
 
 
446 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  32.34 
 
 
446 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.96 
 
 
453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.21 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2320  DnaA family protein  33.78 
 
 
461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0326594  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  30.35 
 
 
450 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  31.6 
 
 
446 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  33.1 
 
 
459 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  30.41 
 
 
450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  30.65 
 
 
446 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.84 
 
 
454 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  32.23 
 
 
436 aa  249  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  32.46 
 
 
449 aa  249  9e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1100  chromosomal replication initiation protein  31.57 
 
 
482 aa  248  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.018395 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0001  chromosomal replication initiation protein  31.96 
 
 
470 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000177247  normal  0.980205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  32.75 
 
 
455 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  30.77 
 
 
441 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  30.16 
 
 
440 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0001  chromosomal replication initiation protein  31.03 
 
 
462 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000157699  unclonable  0.0000121376 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.6 
 
 
464 aa  247  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0001  chromosomal replication initiation protein  31.03 
 
 
462 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000998931  unclonable  0.00000000000343779 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0001  chromosomal replication initiation protein  31.03 
 
 
462 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000562887  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0001  chromosomal replication initiation protein  31.03 
 
 
462 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000257358  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  30.11 
 
 
457 aa  246  8e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0008  chromosomal replication initiation protein  31.17 
 
 
460 aa  245  9e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0003  chromosomal replication initiation protein  31.35 
 
 
453 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  30.11 
 
 
457 aa  246  9e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06201  chromosomal replication initiation protein  33.41 
 
 
464 aa  245  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0001  chromosomal replication initiation protein  31.35 
 
 
453 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.755155  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0001  chromosomal replication initiation protein  31.68 
 
 
462 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000211976  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0009  chromosomal replication initiation protein  30.95 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000281375  unclonable  0.0000000000600935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  31.25 
 
 
442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0001  chromosomal replication initiation protein  30.95 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000179736  unclonable  0.0000000000313535 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0001  chromosomal replication initiation protein  30.95 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000724276  unclonable  0.0000176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  32.28 
 
 
445 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  31.61 
 
 
463 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.6 
 
 
462 aa  244  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  31.78 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0001  chromosomal replication initiation protein  30.55 
 
 
482 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.78 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05681  chromosomal replication initiation protein  31.7 
 
 
454 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.263255  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  31.9 
 
 
465 aa  241  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0001  chromosomal replication initiation protein  30.13 
 
 
453 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.82 
 
 
483 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000328329  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0198  chromosomal replication initiation protein  31.09 
 
 
460 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00733858  normal  0.0821352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  31.26 
 
 
465 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5130  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000558594  normal  0.0494414 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  30.43 
 
 
472 aa  240  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.11 
 
 
458 aa  240  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03585  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183504  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4067  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000102031  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4212  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000201887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0001  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000185056  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3915  chromosomal replication initiation protein  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000126813  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  32.2 
 
 
462 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03529  hypothetical protein  31.33 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00951486  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0001  chromosomal replication initiation protein  32.88 
 
 
466 aa  239  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  30 
 
 
519 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  unclonable  1.2245600000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0001  chromosomal replication initiation protein  31.56 
 
 
460 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.831436  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4066  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
466 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000844177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
462 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4123  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
466 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00889574  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4230  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
466 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00725647  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4172  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
466 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.049293  normal  0.324603 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4050  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
466 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0553543  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0001  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
461 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000102323  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  30.97 
 
 
462 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2833  chromosomal replication initiation protein  29.89 
 
 
448 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.56 
 
 
498 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184051 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  30.65 
 
 
451 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4223  chromosomal replication initiation protein  31.12 
 
 
467 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0001  chromosomal replication initiation protein  30.67 
 
 
461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000051  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0001  chromosomal replication initiation protein  30.89 
 
 
461 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000263579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.89 
 
 
461 aa  236  7e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0006  chromosomal replication initiation protein  32.13 
 
 
462 aa  236  9e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  unclonable  0.000000000136332 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  29.63 
 
 
475 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.202829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  33.33 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>