More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2839 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 314 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  42.91 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  42.91 
 
 		 327 aa  259  3e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  40.89 
 
 		 324 aa  223  4e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 292 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 507 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 327 aa  92  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  28.76 
 
 		 1161 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 		 1061 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  26.74 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.56 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  29.6 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  23.62 
 
 		 1162 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.7 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.7 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.7 
 
 		 314 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  28.25 
 
 		 314 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  28.93 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  28.84 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07290  hypothetical protein  25.38 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.43943  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0719  putative sugar transferase  25.68 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  27.78 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 		 206 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3019  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 		 498 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1173  hypothetical protein  35.29 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.4 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2808  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.411544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2758  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 		 496 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000111644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2740  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3018  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.32 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.477867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3022  group 2 family glycosyl transferase  38.32 
 
 		 498 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.74 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  25.58 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 573 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1279  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase, putative  41.38 
 
 		 402 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.029641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  24 
 
 		 213 aa  55.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  33.73 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  28.18 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  38.3 
 
 		 1168 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  37.21 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.15 
 
 		 2401 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.22 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0425  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 		 514 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0423  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.45 
 
 		 518 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  21.82 
 
 		 311 aa  54.3  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3038  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.45 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.654585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.71 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 394 aa  54.3  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1255  glycosyltransferase  28.45 
 
 		 247 aa  54.3  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  hitchhiker  0.000000000031539 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0304  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 458 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 232 aa  53.9  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  24.2 
 
 		 305 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.56 
 
 		 1157 aa  53.9  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0143  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 235 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 314 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  26.15 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.23 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2451  glycosyl transferase family 2  33.73 
 
 		 222 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  35.23 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3180  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 249 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.589075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0562  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.45 
 
 		 524 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0156  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.23 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  35.23 
 
 		 327 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>