More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2168 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 531 aa  1080    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1332  TrkA-N:Ion transport protein  37.52 
 
 		 517 aa  313  5.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.478947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  29.27 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0186  Ion transport protein  30.81 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  27.22 
 
 		 346 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  26.97 
 
 		 347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  26.9 
 
 		 346 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  28.85 
 
 		 384 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  28.39 
 
 		 350 aa  127  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  26.74 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1053  Ion transport protein  29.74 
 
 		 325 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1325  VIC family potassium channel protein  29.74 
 
 		 325 aa  124  6e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.266187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  28.66 
 
 		 350 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  27.36 
 
 		 331 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  27.12 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  30.19 
 
 		 336 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  33.07 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  27.19 
 
 		 332 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 		 350 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  36.15 
 
 		 345 aa  117  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  28.21 
 
 		 350 aa  117  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  28.23 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  26.63 
 
 		 332 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  27.72 
 
 		 352 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  28.3 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  27.39 
 
 		 332 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  30.24 
 
 		 334 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  30.24 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  30.24 
 
 		 330 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  25.88 
 
 		 330 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  26.67 
 
 		 330 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.99 
 
 		 355 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2640  potassium channel protein  33.61 
 
 		 277 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  27.06 
 
 		 350 aa  109  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  26.28 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  25.3 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31.37 
 
 		 337 aa  108  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  28.33 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  30.68 
 
 		 330 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  24.76 
 
 		 351 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  24.76 
 
 		 351 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  24.76 
 
 		 351 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03944  putative potassium channel protein  28.17 
 
 		 311 aa  107  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  32.49 
 
 		 335 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  29.87 
 
 		 366 aa  106  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1456  Ion transport 2 domain protein  25.69 
 
 		 405 aa  106  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  25.79 
 
 		 362 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  24.84 
 
 		 337 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1460  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0703342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.11 
 
 		 351 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1406  TrkA-N  31.72 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  32.49 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1424  TrkA domain-containing protein  31.72 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.753948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  25.88 
 
 		 354 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  32.18 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5447  voltage-dependent potassium channel  34.78 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.0697598 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  26.36 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  28 
 
 		 359 aa  103  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  35.11 
 
 		 346 aa  103  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  24.92 
 
 		 341 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  30.46 
 
 		 338 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  26.13 
 
 		 335 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1358  Ion transport protein  29.56 
 
 		 419 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  30.46 
 
 		 388 aa  100  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  25.39 
 
 		 356 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  25.55 
 
 		 355 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  25.24 
 
 		 352 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  32.11 
 
 		 347 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  25.39 
 
 		 356 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0024  Ion transport protein  32.38 
 
 		 265 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0306194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  25.4 
 
 		 368 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1378  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  28.92 
 
 		 408 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.56 
 
 		 368 aa  97.8  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  25 
 
 		 335 aa  97.8  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  26.69 
 
 		 337 aa  97.4  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  28 
 
 		 395 aa  97.1  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0861  Ion transport protein  30.99 
 
 		 231 aa  97.1  8e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3499  TrkA-N domain protein  27.54 
 
 		 356 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133106  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  29.24 
 
 		 355 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4967  TrkA-N domain protein  28.06 
 
 		 398 aa  96.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  25.8 
 
 		 339 aa  95.5  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  26.85 
 
 		 351 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2779  Ion transport protein  30.41 
 
 		 357 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00211831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2355  TrkA domain-containing protein  24.25 
 
 		 366 aa  93.6  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  26.64 
 
 		 364 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  21.99 
 
 		 352 aa  92.8  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  25.74 
 
 		 364 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3716  voltage-gated potassium channel  26.63 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.947773 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3219  voltage-gated potassium channel  26.01 
 
 		 391 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.630222 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 364 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  26.3 
 
 		 346 aa  91.3  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4068  voltage-gated potassium channel  26.01 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4298  voltage-gated potassium channel  26.01 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 364 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  21.27 
 
 		 359 aa  90.5  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4712  cyclic nucleotide-binding protein  27.78 
 
 		 412 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  30.3 
 
 		 364 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>