140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2054 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  100 
 
 		 196 aa  391  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  44.9 
 
 		 192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  39 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  39 
 
 		 190 aa  138  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  38.78 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  40 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  38.78 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  35.82 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.71 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  36.87 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  33.84 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  37.06 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  37.88 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  37.68 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  37.5 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  34.16 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  36.04 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  36.04 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  36.04 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  37.06 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  34.67 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  35.6 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  33.18 
 
 		 223 aa  107  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  33.16 
 
 		 195 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  34.18 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  32.65 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  38.42 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  32.49 
 
 		 214 aa  97.8  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  34.52 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.33 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  34.24 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  31.94 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  36.08 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  29.95 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.8 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  35.14 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  29.63 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  29.32 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  32.04 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  31.41 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  32.82 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  28.43 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  33.03 
 
 		 114 aa  72  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  29.35 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  32.2 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  42.42 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  48.21 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  39.71 
 
 		 73 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  45 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.14 
 
 		 75 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  42.19 
 
 		 74 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  34.15 
 
 		 117 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  39.29 
 
 		 72 aa  52  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  34.62 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  47.17 
 
 		 70 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.33 
 
 		 75 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  39.13 
 
 		 79 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  31.31 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  40.32 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  47.17 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  31.31 
 
 		 119 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  47.17 
 
 		 70 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  48.08 
 
 		 70 aa  48.5  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  42.42 
 
 		 71 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  45.45 
 
 		 76 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  37.68 
 
 		 76 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.2 
 
 		 75 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  32.86 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  36.07 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  36.07 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  31.13 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  46.6  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  39.34 
 
 		 83 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  31.43 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  34.43 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  31.88 
 
 		 78 aa  45.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  32.86 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  37.04 
 
 		 80 aa  45.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  34.78 
 
 		 76 aa  45.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  27.68 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40.38 
 
 		 75 aa  45.1  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  34.78 
 
 		 84 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  32.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  35.71 
 
 		 76 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  45.1 
 
 		 82 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  38.46 
 
 		 78 aa  44.3  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>