48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_2013 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  864    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  53.7 
 
 		 386 aa  424  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  29.57 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  31.67 
 
 		 368 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  29.03 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  28.41 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  27.71 
 
 		 335 aa  126  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  24.09 
 
 		 332 aa  92  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000245241  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  25.75 
 
 		 336 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  24.32 
 
 		 335 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  25.5 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.48 
 
 		 341 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  26.84 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  26.77 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  24.52 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  24.52 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  25 
 
 		 341 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  27.14 
 
 		 331 aa  62.4  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000126536  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  24.52 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  22.66 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0720  spore photoproduct lyase  26.7 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0712219  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1237  hypothetical protein  28.8 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.231628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1857  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 354 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532474 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  23.4 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  32.69 
 
 		 342 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  24.25 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173731  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22270  spore photoproduct lyase  27.01 
 
 		 340 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5436  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 355 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3136  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 354 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2977  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3457  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 354 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  27.11 
 
 		 340 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3333  Radical SAM domain protein  23.69 
 
 		 354 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2341  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 357 aa  46.6  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0393103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0827  radical SAM domain protein  22.5 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5726  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.297493  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1656  radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 353 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2944  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 371 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3293  spore photoproduct lyase  24.37 
 
 		 363 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>